RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-222	ENST00000592408	GAP43	P17677	238 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	GMPR	P36959	345 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	MMP14	P50281	582 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	KIF11	P52732	1056 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	TCP10	Q12799	353 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	IRF5	Q13568	498 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	TERF2	Q15554	542 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	TAF3	Q5VWG9	929 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PDXDC1	Q6P996	788 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	DNM3	Q9UQ16	869 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	UBE4B	O95155	1302 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCDC66	A2RUB6	948 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP17L15	C9J2P7	530 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP17L11	C9JVI0	530 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP17L18	D6R9N7	530 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP17L22	D6RA61	530 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP17L19	D6RCP7	530 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP17L20	D6RJB6	530 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408		F5H6K3	240 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	LILRB3	O75022	631 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ADH1C	P00326	375 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	SERPING1	P05155	500 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	MUT	P22033	750 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANXA13	P27216	316 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	RPA1	P27694	616 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	CIITA	P33076	1130 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF76	P36508	570 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	GRM5	P41594	1212 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ITIH3	Q06033	890 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	KLRC3	Q07444	240 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP17L24	Q0WX57	530 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRR16	Q569H4	304 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	WDR93	Q6P2C0	686 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	RRAGA	Q7L523	313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	KCNK18	Q7Z418	384 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	HPS3	Q969F9	1004 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	CDK15	Q96Q40	435 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408		A0A0U1RQJ8	604 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRRC53	A6NM62	1247 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408		E9PMD0	336 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	MEIS2	O14770	477 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	EDIL3	O43854	480 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	GDF11	O95390	407 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	CYP3A4	P08684	503 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRLR	P16471	622 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	CYP11B2	P19099	503 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PLA2G4A	P47712	749 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	KLK7	P49862	253 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	STAT2	P52630	851 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC12A3	P55017	1021 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	BANK1	Q8NDB2	785 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		10.12	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms