RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.78■■□□□ 1.24
GIPC1-211ENST00000589631 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
GIPC1-211ENST00000589631 MAGEB2O15479 319 aa22.77■■□□□ 1.24
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF862O60290 1169 aa22.77■■□□□ 1.24
GIPC1-211ENST00000589631 C22orf31O95567 290 aa22.77■■□□□ 1.24
GIPC1-211ENST00000589631 SPRED2Q7Z698 418 aa22.77■■□□□ 1.24
GIPC1-211ENST00000589631 OXER1Q8TDS5 423 aa22.77■■□□□ 1.24
GIPC1-211ENST00000589631 PPM1EQ8WY54 764 aa22.77■■□□□ 1.24
GIPC1-211ENST00000589631 GJA10Q969M2 543 aa22.77■■□□□ 1.24
GIPC1-211ENST00000589631 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.77■■□□□ 1.24
GIPC1-211ENST00000589631 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.77■■□□□ 1.24
GIPC1-211ENST00000589631 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.77■■□□□ 1.24
GIPC1-211ENST00000589631 CHMP2AO43633 222 aa22.76■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 UPP2O95045 317 aa22.76■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 OATP04181 439 aa22.76■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 CD52P31358 61 aa22.76■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.76■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.76■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 FAM20AQ96MK3 541 aa22.76■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 YME1L1Q96TA2 773 aa22.76■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.76■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 EYSQ5T1H1 3165 aa22.75■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 COL4A6Q14031 1691 aa22.75■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 DLL1O00548 723 aa22.75■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 SLC37A4O43826 429 aa22.75■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 KRT2P35908 639 aa22.75■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 GRB10Q13322 594 aa22.75■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.75■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.75■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 PADI3Q9ULW8 664 aa22.75■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 TBX3O15119 743 aa22.74■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 LPXNO60711 386 aa22.74■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 PRKCEQ02156 737 aa22.74■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 UGCGQ16739 394 aa22.74■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.74■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 TNFRSF25Q93038 417 aa22.74■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 SAMD11Q96NU1 681 aa22.74■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 KIF2CQ99661 725 aa22.74■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.74■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 TRANK1O15050 2925 aa22.73■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.73■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 JAK2O60674 1132 aa22.73■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 MMP1P03956 469 aa22.73■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 ST3GAL1Q11201 340 aa22.73■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 PAK2Q13177 524 aa22.73■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 ODR4Q5SWX8 454 aa22.73■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 METTL13Q8N6R0 699 aa22.73■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.73■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.73■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 TMOD1P28289 359 aa22.72■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 NR5A1Q13285 461 aa22.72■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 PPP2R5CQ13362 524 aa22.72■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 TRIM29Q14134 588 aa22.72■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 XKR3Q5GH77 459 aa22.72■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.72■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.72■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 GPR32O75388 356 aa22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 RPS6KA5O75582 802 aa22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 STBD1O95210 358 aa22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 KRT40Q6A162 431 aa22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 HAS1Q92839 578 aa22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 VAV3Q9UKW4 847 aa22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 GINS2Q9Y248 185 aa22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GIPC1-211ENST00000589631 A0A0C4DFX4 3053 aa22.7■■□□□ 1.22
GIPC1-211ENST00000589631 BTBD18B2RXH4 712 aa22.7■■□□□ 1.22
GIPC1-211ENST00000589631 GPR182O15218 404 aa22.7■■□□□ 1.22
GIPC1-211ENST00000589631 PSMC5P62195 406 aa22.7■■□□□ 1.22
GIPC1-211ENST00000589631 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
GIPC1-211ENST00000589631 KIZQ2M2Z5 673 aa22.7■■□□□ 1.22
GIPC1-211ENST00000589631 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.7■■□□□ 1.22
GIPC1-211ENST00000589631 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.7■■□□□ 1.22
GIPC1-211ENST00000589631 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.7■■□□□ 1.22
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.7■■□□□ 1.22
GIPC1-211ENST00000589631 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
GIPC1-211ENST00000589631 MAP7D2Q96T17 732 aa22.7■■□□□ 1.22
GIPC1-211ENST00000589631 TMX1Q9H3N1 280 aa22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms