RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 DAW1Q8N136 415 aa28.86■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 SPATA33Q96N06 139 aa28.86■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 ZHX3Q9H4I2 956 aa28.86■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 TBC1D7Q9P0N9 293 aa28.86■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM49BA6NDI0 452 aa28.85■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 GAP43P17677 238 aa28.85■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 CCNE1P24864 410 aa28.85■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 LRRC41Q15345 812 aa28.85■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 APBA2Q99767 749 aa28.85■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 OLFML3Q9NRN5 406 aa28.85■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 LGR5O75473 907 aa28.85■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 IRF5Q13568 498 aa28.85■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 TTI2Q6NXR4 508 aa28.85■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 P2RX5Q93086 422 aa28.85■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 CFHR5Q9BXR6 569 aa28.85■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa28.85■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 USO1O60763 962 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 HIP1RO75146 1068 aa28.84■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM13AO94988 1023 aa28.84■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP2B6P20813 491 aa28.84■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 CCL14Q16627 93 aa28.84■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 CDKAL1Q5VV42 579 aa28.84■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 OLFML2BQ68BL8 750 aa28.84■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 CENPPQ6IPU0 288 aa28.84■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM47Q96LD4 638 aa28.84■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 PARVGQ9HBI0 331 aa28.84■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 SFI1A8K8P3 1242 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 NOP56O00567 594 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 OATP04181 439 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF75DP51815 510 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM160B1Q5W0V3 765 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 MYOCDQ8IZQ8 938 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM5Q9C035 493 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 SEMA6BQ9H3T3 888 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 GH1P01241 217 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 MAP2K2P36507 400 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 PSMC4P43686 418 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 VEGFBP49765 207 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 STAT5BP51692 787 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 CASP5P51878 434 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 FCGRTP55899 365 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 LAMC2Q13753 1193 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 SCFD1Q8WVM8 642 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 CEP170P1Q96L14 293 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 FIZ1Q96SL8 496 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 TIPINQ9BVW5 301 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP26B1Q9NR63 512 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 SEL1LQ9UBV2 794 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 MYH11P35749 1972 aa28.82■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 EMSYQ7Z589 1322 aa28.82■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 TBC1D8O95759 1140 aa28.82■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 DUSP28Q4G0W2 176 aa28.82■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 SMPD1P17405 629 aa28.81■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC144BQ3MJ40 725 aa28.81■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa28.81■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD40Q6AI12 368 aa28.81■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 IQSEC1Q6DN90 963 aa28.81■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 MYCT1Q8N699 235 aa28.81■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 PDLIM7Q9NR12 457 aa28.81■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 THSD7BQ9C0I4 1608 aa28.81■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 BICDL2A1A5D9 508 aa28.8■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 ADCY6O43306 1168 aa28.8■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 FANCCQ00597 558 aa28.8■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa28.8■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 AZI2Q9H6S1 392 aa28.8■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP2C19P33261 490 aa28.8■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 HTRA3P83110 453 aa28.8■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 FOXR2Q6PJQ5 311 aa28.8■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM50Q86XT4 487 aa28.8■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 CEP89Q96ST8 783 aa28.8■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 CAP1Q01518 475 aa28.79■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 ZCWPW2Q504Y3 356 aa28.79■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa28.79■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 MAEAQ7L5Y9 396 aa28.79■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 PPTC7Q8NI37 304 aa28.79■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP28.78■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 DGAT1O75907 488 aa28.78■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 MYBP10242 640 aa28.78■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 BMT2Q1RMZ1 405 aa28.78■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 ODR4Q5SWX8 454 aa28.78■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa28.78■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF186Q9NXI6 227 aa28.78■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 MTERF2Q49AM1 385 aa28.78■■■□□ 2.2
SCAMP4-210ENST00000588555 IRF2BP1Q8IU81 584 aa28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms