RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RINT1Q6NUQ1 792 aa26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NSMFQ6X4W1 530 aa26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPS6KA5O75582 802 aa26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC40Q4G0X9 1142 aa26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HPCAL4Q9UM19 191 aa26.47■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SIK3Q9Y2K2 1263 aa26.47■■□□□ 1.83
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCNX4Q63HM2 1172 aa26.46■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCTD17Q8N5Z5 321 aa26.46■■□□□ 1.83
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RIT2Q99578 217 aa26.46■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLAGL2Q9UPG8 496 aa26.46■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RIPK3Q9Y572 518 aa26.46■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYBP10242 640 aa26.46■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF5AQ12840 1032 aa26.46■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EPHA7Q15375 998 aa26.46■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TKFCQ3LXA3 575 aa26.46■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 B3GNT9Q6UX72 402 aa26.46■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF207Q6ZRF8 634 aa26.46■■□□□ 1.83
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LXNQ9BS40 222 aa26.46■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SFI1A8K8P3 1242 aa26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EPHB6O15197 1021 aa26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BCRP11274 1271 aa26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSGA10Q9BZW7 698 aa26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF146Q9NTX7 359 aa26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DLK2Q6UY11 383 aa26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COG1Q8WTW3 980 aa26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC42Q96M95 316 aa26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP63Q96MT8 703 aa26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPON1Q9HCB6 807 aa26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM51Q9NW97 253 aa26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa26.45■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FDX1P10109 184 aa26.44■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYBL2P10244 700 aa26.44■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PGM5Q15124 567 aa26.44■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RMDN3Q96TC7 470 aa26.44■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PHIPQ8WWQ0 1821 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZMYND10O75800 440 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MTMR1Q13613 665 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LEKR1Q6ZMV7 388 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C1orf186Q6ZWK4 172 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MIER3Q7Z3K6 550 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NACC1Q96RE7 527 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM204AQ9H8W3 233 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF40O75150 1001 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GCNT3O95395 438 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCA5LO95447 670 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NIPA1Q7RTP0 329 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CREG2Q8IUH2 290 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CAGE1Q8TC20 777 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C12orf42Q96LP6 360 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 JADE2Q9NQC1 790 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PNMA2Q9UL42 364 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNX12Q9UMY4 172 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FRMPD4Q14CM0 1322 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C19orf81C9J6K1 198 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM13AO94988 1023 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPA17Q15506 151 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC155Q8N6L0 562 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MMRN2Q9H8L6 949 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DSG3P32926 999 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C2orf54Q08AI8 447 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
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