RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575507.1

EDC4-210, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, human

TSL 2

Gene EDC4, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDC4-210	ENST00000575507	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		16.01	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		16.01	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		16.01	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	INSL6	Q9Y581	213 aa		16.01	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		16.01	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	TMEM150B	A6NC51	233 aa		16	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	EML1	O00423	815 aa		16	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	DLL1	O00548	723 aa		16	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	WNT7A	O00755	349 aa		16	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	FOSB	P53539	338 aa		16	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		16	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		16	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	NME8	Q8N427	588 aa		16	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		16	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	TMX1	Q9H3N1	280 aa		16	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	PADI3	Q9ULW8	664 aa		16	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	COL1A2	P08123	1366 aa		16	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		15.99	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	SI	P14410	1827 aa		15.99	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	EYS	Q5T1H1	3165 aa		15.99	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		15.99	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	NEK8	Q86SG6	692 aa		15.99	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		15.99	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		15.99	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	HAS1	Q92839	578 aa		15.99	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	CEP89	Q96ST8	783 aa		15.99	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		15.99	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		15.99	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		15.99	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		15.99	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	BTBD18	B2RXH4	712 aa		15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	MGEA5	O60502	916 aa		15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	GPR32	O75388	356 aa		15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	VTN	P04004	478 aa		15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	OAT	P04181	439 aa		15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	LINC00271	P0C7V0	271 aa		15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	SFN	P31947	248 aa		15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	CLCN3	P51790	818 aa		15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	PRKCE	Q02156	737 aa		15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	VAV3	Q9UKW4	847 aa		15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	GINS2	Q9Y248	185 aa		15.98	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	MMP1	P03956	469 aa		15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	XBP1	P17861	261 aa		15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	JAK3	P52333	1124 aa		15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	DRP2	Q13474	957 aa		15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	METTL13	Q8N6R0	699 aa		15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	WASF1	Q92558	559 aa		15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	YME1L1	Q96TA2	773 aa		15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		15.97	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507		M0QZ92	97 aa		15.96	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	KRT2	P35908	639 aa		15.96	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	POTED	Q86YR6	584 aa		15.96	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	BANK1	Q8NDB2	785 aa		15.96	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	RDM1	Q8NG50	284 aa		15.96	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	OSMR	Q99650	979 aa		15.96	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		15.96	■□□□□ 0.15
EDC4-210	ENST00000575507	DGKI	O75912	1065 aa		15.95	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	GUCY1B3	Q02153	619 aa		15.95	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		15.95	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	PAK2	Q13177	524 aa		15.95	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	PPP2R5C	Q13362	524 aa		15.95	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	EPC2	Q52LR7	807 aa		15.95	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	ANO5	Q75V66	913 aa		15.95	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	FAM167A	Q96KS9	214 aa		15.95	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	FAM20A	Q96MK3	541 aa		15.95	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		15.95	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		15.94	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		15.94	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	MAGEB2	O15479	319 aa		15.94	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	RPS6KA5	O75582	802 aa		15.94	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
EDC4-210	ENST00000575507	GATM	P50440	423 aa		15.94	■□□□□ 0.14

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