RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569573.1

E2F4-213, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-213ENST00000569573 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa29.1■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 TMX1Q9H3N1 280 aa29.1■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 AAASQ9NRG9 546 aa29.1■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa29.1■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa29.1■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 CCNE2O96020 404 aa29.09■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 DNAJB1P25685 340 aa29.09■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 FUT2Q10981 343 aa29.09■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 ZNF484Q5JVG2 852 aa29.09■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa29.09■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 ABHD15Q6UXT9 468 aa29.09■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa29.09■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 C1orf112Q9NSG2 853 aa29.09■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 COL1A2P08123 1366 aa29.09■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa29.08■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 NRIP1P48552 1158 aa29.08■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 KRT32Q14532 448 aa29.08■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 SWSAP1Q6NVH7 229 aa29.08■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 EFHBQ8N7U6 833 aa29.08■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 ADAM2Q99965 735 aa29.08■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 ERVK-5Q9HDB9 667 aa29.08■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
E2F4-213ENST00000569573 TBKBP1A7MCY6 615 aa29.07■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 GPR182O15218 404 aa29.07■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 CLK2P49760 499 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 BMP2KLQ5H9B9 411 aa29.07■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa29.07■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 PPP1R16BQ96T49 567 aa29.07■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 KIAA1671Q9BY89 1806 aa29.07■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 MUTYHQ9UIF7 546 aa29.07■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 FAM86B1E9PN63 330 aa29.06■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 FAM86B2P0C5J1 330 aa29.06■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 SLC24A5Q71RS6 500 aa29.06■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 RNF135Q8IUD6 432 aa29.06■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 ZNF577Q9BSK1 485 aa29.06■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa29.06■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa29.05■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 CDC27P30260 824 aa29.05■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 SETQ01105 290 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 ADCK5Q3MIX3 580 aa29.05■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 METTL13Q8N6R0 699 aa29.05■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 MSLNLQ96KJ4 702 aa29.05■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 TLE6Q9H808 572 aa29.05■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 CDHR5Q9HBB8 845 aa29.05■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 C6orf50Q9HD87 102 aa29.05■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 RGS18Q9NS28 235 aa29.05■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 MGEA5O60502 916 aa29.04■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.243e-6■■□□□ 14.5
E2F4-213ENST00000569573 RCAN1P53805 252 aa29.04■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 MCTP2Q6DN12 878 aa29.04■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 THNSL1Q8IYQ7 743 aa29.04■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 TMEM40Q8WWA1 233 aa29.04■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 TBC1D22BQ9NU19 505 aa29.04■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 MUC6Q6W4X9 2439 aa29.03■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 EYA4O95677 639 aa29.03■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 UBE3AQ05086 875 aa29.03■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 KIZQ2M2Z5 673 aa29.03■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 TSGA10IPQ3SY00 556 aa29.03■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 RASEFQ8IZ41 740 aa29.03■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 OSMRQ99650 979 aa29.03■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa29.03■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 TLR9Q9NR96 1032 aa29.03■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 CLEC1BQ9P126 229 aa29.03■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 SAMM50Q9Y512 469 aa29.03■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 DHX15O43143 795 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 PSAPP07602 524 aa29.02■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 CYP3A4P08684 503 aa29.02■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 COASYQ13057 564 aa29.02■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 FAM102BQ5T8I3 360 aa29.02■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 SMRP1Q8NCR6 262 aa29.02■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 MFSD14AQ96MC6 490 aa29.02■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 KCNH6Q9H252 994 aa29.02■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 CEP131Q9UPN4 1083 aa29.02■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa29.02■■■□□ 2.24
E2F4-213ENST00000569573 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa29.01■■■□□ 2.23
E2F4-213ENST00000569573 FGF18O76093 207 aa29.01■■■□□ 2.23
E2F4-213ENST00000569573 C22orf31O95567 290 aa29.01■■■□□ 2.23
E2F4-213ENST00000569573 VTNP04004 478 aa29.01■■■□□ 2.23
E2F4-213ENST00000569573 ADD1P35611 737 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
E2F4-213ENST00000569573 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
E2F4-213ENST00000569573 HFE2Q6ZVN8 426 aa29.01■■■□□ 2.23
E2F4-213ENST00000569573 FSD2A1L4K1 749 aa29■■■□□ 2.23
E2F4-213ENST00000569573 C9IYK1 514 aa29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms