RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 CAPN1P07384 714 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 CASP14P31944 242 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 IFNAR2P48551 515 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 PI16Q6UXB8 463 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 MMP19Q99542 508 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 SP110Q9HB58 689 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 MED23Q9ULK4 1368 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ARHGAP6O43182 974 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 PRKAB2O43741 272 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ALDH1A2O94788 518 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 SLC9A1P19634 815 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 CCT5P48643 541 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 MAP3K7CLP57077 242 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 GUCY2DQ02846 1103 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ART3Q13508 389 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 RD3Q7Z3Z2 195 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 PCGF5Q86SE9 256 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 EXOC8Q8IYI6 725 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 DCUN1D1Q96GG9 259 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 SYNMO15061 1565 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 AKT1P31749 480 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 DPCR1Q3MIW9 517 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 PARP10Q53GL7 1025 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 CIAPIN1Q6FI81 312 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 KRT77Q7Z794 578 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 AIFM3Q96NN9 605 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ZHX2Q9Y6X8 837 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 MAGI2Q86UL8 1455 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 NSFP46459 744 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ARID5BQ14865 1188 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 THNSL1Q8IYQ7 743 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ZNF614Q8N883 585 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 RMDN1Q96DB5 314 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 TADA2AO75478 443 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 PEX19P40855 299 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 STAT1P42224 750 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 CHRNDQ07001 517 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 BTN2A1Q7KYR7 527 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 BABAM1Q9NWV8 329 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 WDR17Q8IZU2 1322 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 CYBBP04839 570 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 CACNB3P54284 484 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 USP14P54578 494 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 POU5F1BQ06416 359 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 PDCLQ13371 301 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 KRT39Q6A163 491 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ZNF304Q9HCX3 659 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ZNF212Q9UDV6 495 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa9.05□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 TIPRLO75663 272 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 CHEK2O96017 543 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 KRT1P04264 644 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ADORA2BP29275 332 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 RASEFQ8IZ41 740 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 SYCE1Q8N0S2 351 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ARHGEF10O15013 1369 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 TNKSO95271 1327 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 CASP1P29466 404 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 RASSF2P50749 326 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 UBE2SQ16763 222 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 RCSD1Q6JBY9 416 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 ARMCX2Q7L311 632 aa9.04□□□□□ -0.96
PDPR-210ENST00000568530 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms