RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568514.5

SNAP23-218, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 3

Gene SNAP23, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-218	ENST00000568514	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	GPR42	O15529	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	KRT37	O76014	449 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	AOAH	P28039	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CSF2RB	P32927	897 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	GGN	Q86UU5	652 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	EFCAB14	O75071	495 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	PTGS1	P23219	599 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CD83	Q01151	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ICAM4	Q14773	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ACAP1	Q15027	740 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514		Q6ZUG5	572 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	MAPKBP1	O60336	1514 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	FBXO21	O94952	628 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	PLAT	P00750	562 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	RRAD	P55042	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	LGI4	Q8N135	537 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	INCENP	Q9NQS7	918 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CEP162	Q5TB80	1403 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ATP10B	O94823	1461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ZNF536	O15090	1300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	LCHN	A4D1U4	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	OPA1	O60313	960 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	JMJD7	P0C870	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	IRF9	Q00978	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	FANCL	Q9NW38	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-218	ENST00000568514	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-218	ENST00000568514	HECW1	Q76N89	1606 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-218	ENST00000568514	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-218	ENST00000568514	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-218	ENST00000568514	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-218	ENST00000568514	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-218	ENST00000568514	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-218	ENST00000568514	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-218	ENST00000568514		H0Y858	1186 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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