RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, human

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNDBP1-210	ENST00000566882	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	RNF146	Q9NTX7	359 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	CTAGE9	A4FU28	777 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	KIF11	P52732	1056 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	KLRG1	Q96E93	195 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	NACC1	Q96RE7	527 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	JADE2	Q9NQC1	790 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	PXMP2	Q9NR77	195 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	PICK1	Q9NRD5	415 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	ZBED4	O75132	1171 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	DMTN	Q08495	405 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	FSTL1	Q12841	308 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	ODR4	Q5SWX8	454 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	PADI6	Q6TGC4	694 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	RIT2	Q99578	217 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	PARVG	Q9HBI0	331 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	MYH10	P35580	1976 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	PDXK	O00764	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	NPEPPS	P55786	919 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	SOX10	P56693	466 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	AMPD2	Q01433	879 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	SP4	Q02446	784 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	RDH13	Q8NBN7	331 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	DRC1	Q96MC2	740 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	GAN	Q9H2C0	597 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	CDC23	Q9UJX2	597 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	ZNF185	O15231	689 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	RGS20	O76081	388 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	CYP2J2	P51589	502 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	GHRHR	Q02643	423 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	DCAF15	Q66K64	600 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	CCDC125	Q86Z20	511 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	SLC35C1	Q96A29	364 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	BACH1	O14867	736 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	AKR1B10	O60218	316 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	LRRN2	O75325	713 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	MOCS3	O95396	460 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	BCR	P11274	1271 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	ZNF131	P52739	623 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	DEF6	Q9H4E7	631 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	STK24	Q9Y6E0	443 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	ADM5	C9JUS6	153 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	KIF20A	O95235	890 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	GNA14	O95837	355 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	TRIM49	P0CI25	452 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	TRIM49C	P0CI26	452 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	PON1	P27169	355 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	RARRES1	P49788	294 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	USP14	P54578	494 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	KRT83	P78385	493 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	CDK17	Q00537	523 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	TREML2	Q5T2D2	321 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	MOB2	Q70IA6	237 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	BORCS6	Q96GS4	357 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CCNDBP1-210	ENST00000566882	CEP72	Q9P209	647 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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