RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
MEIS3-212ENST00000561293 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.7■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 PLCG1P19174 1290 aa23.7■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 FAAP100Q0VG06 881 aa23.7■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 XKR9Q5GH70 373 aa23.7■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 XKR3Q5GH77 459 aa23.7■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 C4orf19Q8IY42 314 aa23.7■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 DPF3Q92784 378 aa23.7■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 NOD1Q9Y239 953 aa23.7■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 A0A1B0GVL5 298 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 HBP1O60381 514 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 KLRC1P26715 233 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 SNX17Q15036 470 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 METTL13Q8N6R0 699 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 BHMT2Q9H2M3 363 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 CUTAO60888 179 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 ITGB8P26012 769 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 CLCN3P51790 818 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.69■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 ALPK3Q96L96 1907 aa23.68■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 SLC26A2P50443 739 aa23.68■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 ADAM17P78536 824 aa23.68■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 AK8Q96MA6 479 aa23.68■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 CEP89Q96ST8 783 aa23.68■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.68■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 NRCAMQ92823 1304 aa23.68■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 CTSHP09668 335 aa23.67■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 RARRES1P49788 294 aa23.67■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.67■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 STAMQ92783 540 aa23.67■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.67■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 C22orf31O95567 290 aa23.67■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 CD4P01730 458 aa23.67■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 HOXC8P31273 242 aa23.67■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.67■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 NEK9Q8TD19 979 aa23.67■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM119Q4V9L6 283 aa23.66■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.66■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM143Q96AN5 459 aa23.66■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 FAM167AQ96KS9 214 aa23.66■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.66■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.66■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa23.66■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 DCDC2CA8MYV0 355 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 EVI5O60447 810 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 MCM6Q14566 821 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 SESTD1Q86VW0 696 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 DHX58Q96C10 678 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 CALML4Q96GE6 196 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 GINS2Q9Y248 185 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 VTNP04004 478 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 RESP18Q5W5W9 173 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 NACC1Q96RE7 527 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.65■■□□□ 1.38
MEIS3-212ENST00000561293 LYPLA2O95372 231 aa23.64■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 CLTBP09497 229 aa23.64■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 PFKFB1P16118 471 aa23.64■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 CYP2C18P33260 490 aa23.64■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 CCL23P55773 120 aa23.64■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.64■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 KSR1Q8IVT5 923 aa23.64■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.64■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 DNM3Q9UQ16 869 aa23.64■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 KAT6AQ92794 2004 aa23.63■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 THPOP40225 353 aa23.63■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 NDUFA8P51970 172 aa23.63■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF484Q5JVG2 852 aa23.63■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 C1orf53Q5VUE5 145 aa23.63■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 ADALQ6DHV7 355 aa23.63■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 SERINC5Q86VE9 423 aa23.63■■□□□ 1.37
MEIS3-212ENST00000561293 FSIP1Q8NA03 581 aa23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms