RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-223ENST00000551137 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 KCNMB3Q9NPA1 279 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 NRBP2Q9NSY0 501 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 GABBR1Q9UBS5 961 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 VCANP13611 3396 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 DLL1O00548 723 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 TBX3O15119 743 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 LARGE1O95461 756 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 GRB10Q13322 594 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 C8orf34Q49A92 452 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 SPRED2Q7Z698 418 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 NEK8Q86SG6 692 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 NECAB1Q8N987 351 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 TNFRSF25Q93038 417 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 UIMC1Q96RL1 719 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 UNC45AQ9H3U1 944 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 CERS4Q9HA82 394 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 SUGCTQ9HAC7 445 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 PADI3Q9ULW8 664 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 SAMM50Q9Y512 469 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-223ENST00000551137 BRWD1Q9NSI6 2320 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 RFXAPO00287 272 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 OATP04181 439 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 CD52P31358 61 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 PPP2R5CQ13362 524 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 ODR4Q5SWX8 454 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 FAM117BQ6P1L5 589 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 CKAP2LQ8IYA6 745 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 IL27Q8NEV9 243 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 OXER1Q8TDS5 423 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 KIF2CQ99661 725 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 GJB4Q9NTQ9 266 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 STBD1O95210 358 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 LINC00271P0C7V0 271 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 TMEM62Q0P6H9 643 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 PAK2Q13177 524 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 LETM2Q2VYF4 491 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 XKR3Q5GH77 459 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 MIER3Q7Z3K6 550 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 LINC01599Q8WXQ3 324 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 CEP89Q96ST8 783 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 YME1L1Q96TA2 773 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 ERVK-5Q9HDB9 667 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 VAV3Q9UKW4 847 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 C5orf67F2Z3F1 127 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 SLC37A4O43826 429 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 GPR32O75388 356 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 DGKIO75912 1065 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 UPP2O95045 317 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 MMP1P03956 469 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 TMOD1P28289 359 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 KRT2P35908 639 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 RBM25P49756 843 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 CDC42EP1Q00587 391 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 PRKCEQ02156 737 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 ST3GAL1Q11201 340 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 UGCGQ16739 394 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 EPC2Q52LR7 807 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 TJAP1Q5JTD0 557 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 HAS1Q92839 578 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 GJA10Q969M2 543 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 C17orf80Q9BSJ5 609 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 ADAMTS10Q9H324 1103 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 TMX1Q9H3N1 280 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 CDHR5Q9HBB8 845 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 BRMS1Q9HCU9 246 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 THEGQ9P2T0 379 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 BDP1A6H8Y1 2624 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 H3BNC9 293 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 GPR182O15218 404 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 CHMP2AO43633 222 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 RPS6KA5O75582 802 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-223ENST00000551137 RB1P06400 928 aa12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms