RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 MTERF2Q49AM1 385 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 RASEFQ8IZ41 740 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 ACAP3Q96P50 834 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 ITSN1Q15811 1721 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 ASAP2O43150 1006 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 ACTN1P12814 892 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 SESTD1Q86VW0 696 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM47Q9BQJ4 181 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 CHEK2O96017 543 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 FCER1AP12319 257 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 RFC5P40937 340 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 CENPUQ71F23 418 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 ERICH1Q86X53 443 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 STAMQ92783 540 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 KIF2CQ99661 725 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 EFHD1Q9BUP0 239 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 KLC2Q9H0B6 622 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 TLK1Q9UKI8 766 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 PPME1Q9Y570 386 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 RBL2Q08999 1139 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 E2F5Q15329 346 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 CEP57Q86XR8 500 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 DRC3Q9H069 523 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 VPS33BQ9H267 617 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 STAP1Q9ULZ2 295 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PQC6 194 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 GSTA1P08263 222 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 GSTA2P09210 222 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 PPCSQ9HAB8 311 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 MYL3P08590 195 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 SATB1Q01826 763 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 RASSF7Q02833 373 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 EMBQ6PCB8 327 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 LRGUKQ96M69 825 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC151A5D8V7 595 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 GPC4O75487 556 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 PDE1BQ01064 536 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 OR6B2Q6IFH4 312 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 GPT2Q8TD30 523 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 MRGBPQ9NV56 204 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 ZNRF3Q9ULT6 936 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 MYO3AQ8NEV4 1616 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 LGALS16A8MUM7 142 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 RAD17O75943 681 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 MESDQ14696 234 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 IP6K2Q9UHH9 426 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 PTPRMP28827 1452 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 SMAPO00193 183 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 HUS1O60921 280 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 GH2P01242 217 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC31Q6UY01 552 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 PGBD4Q96DM1 585 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 VPS39Q96JC1 886 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 BUB1O43683 1085 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 PRKAB2O43741 272 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV5-2P06315 115 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 IQCB1Q15051 598 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 RMDN3Q96TC7 470 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 KRT7P08729 469 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 KLHL38Q2WGJ6 581 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 CEP120Q8N960 986 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 FBXO41Q8TF61 875 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 LY9Q9HBG7 655 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-208ENST00000550358 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms