RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 CEP72Q9P209 647 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 CAPN14A8MX76 684 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 KLF4O43474 513 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 MPIG6BO95866 241 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 WDR48Q8TAF3 677 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 BTBD2Q9BX70 525 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 AMNQ9BXJ7 453 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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PTPRK-220ENST00000531466 WNT9AO14904 365 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRK-220ENST00000531466 ECE1P42892 770 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 HGFACQ04756 655 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRK-220ENST00000531466 ZG16BQ96DA0 208 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 AGAP2Q99490 1192 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 Q9UFV3 132 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 SLC26A4O43511 780 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 STAT5BP51692 787 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 ST5P78524 1137 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 GUCY1A3Q02108 690 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 MOGSQ13724 837 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 MMEP08473 750 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 HERVK_113P62684 666 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 CRHR2Q13324 411 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 SEC23AQ15436 765 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 CRY1Q16526 586 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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PTPRK-220ENST00000531466 OR10A5Q9H207 317 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPRK-220ENST00000531466 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 PPFIA2O75334 1257 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 DNM2P50570 870 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRK-220ENST00000531466 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 CYP27B1O15528 508 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 RAMP2O60895 175 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 STAT3P40763 770 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 RIN1Q13671 783 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 TM4SF20Q53R12 229 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 FAM209AQ5JX71 171 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 SPATC1Q76KD6 591 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 TTPALQ9BTX7 342 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 SCDO00767 359 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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PTPRK-220ENST00000531466 RAB33AQ14088 237 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.23□□□□□ -1.25
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PTPRK-220ENST00000531466 Q6ZPA2 131 aa7.23□□□□□ -1.25
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PTPRK-220ENST00000531466 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 ASB15Q8WXK1 588 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 ADCY3O60266 1144 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 TCF3P15923 654 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 SCNN1GP51170 649 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 ACAP1Q15027 740 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 HIPK4Q8NE63 616 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-220ENST00000531466 A0A1W2PRX2 142 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-220ENST00000531466 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-220ENST00000531466 GSTA4O15217 222 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-220ENST00000531466 SLC25A3Q00325 362 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-220ENST00000531466 ADAM15Q13444 863 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-220ENST00000531466 Q6ZRM9 215 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
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