RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528140.5

MYB-223, Transcript of MYB proto-oncogene, transcription factor, human

TSL 1 (best)

Gene MYB, Length 2,021 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYB-223	ENST00000528140	EFCAB14	O75071	495 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	CTSH	P09668	335 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	RPS6KB1	P23443	525 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	MARK3	P27448	753 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	PSMA5	P28066	241 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	ARHGAP4	P98171	946 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	IKBKE	Q14164	716 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	ADGRE1	Q14246	886 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	SYCP1	Q15431	976 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	CEP55	Q53EZ4	464 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	USP38	Q8NB14	1042 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	ANKRD7	Q92527	254 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	GLG1	Q92896	1179 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	NRCAM	Q92823	1304 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	CAND2	O75155	1236 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	LGR5	O75473	907 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	SLFN14	P0C7P3	912 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	SCG2	P13521	617 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	DEFB103A	P81534	67 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	PPFIA1	Q13136	1202 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	AP3B2	Q13367	1082 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	TCTN1	Q2MV58	587 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	FBXL16	Q8N461	479 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	CEP120	Q8N960	986 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	TTC13	Q8NBP0	860 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	SDF4	Q9BRK5	362 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	ANO3	Q9BYT9	981 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	CERS4	Q9HA82	394 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	TMEM260	Q9NX78	707 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	REV3L	O60673	3130 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	NID2	Q14112	1375 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	RCCD1	A6NED2	376 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	PPFIA3	O75145	1194 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	ARHGEF15	O94989	841 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	GJB5	O95377	273 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	ZNF76	P36508	570 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	SREBF1	P36956	1147 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	TAP1	Q03518	808 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	RUFY3	Q7L099	469 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	PHKB	Q93100	1093 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	AZI2	Q9H6S1	392 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	TRANK1	O15050	2925 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	NFASC	O94856	1347 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	LCHN	A4D1U4	455 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	MEIS1	O00470	390 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	AMH	P03971	560 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	AR	P10275	920 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	6.57	□□□□□ -1.36	2e-6	■■■■□ 23.2
MYB-223	ENST00000528140	GNA11	P29992	359 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	ACTR2	P61160	394 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	ADAM17	P78536	824 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	TERF2	Q15554	542 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	GRIK4	Q16099	956 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	PKN1	Q16512	942 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	SEPT8	Q92599	483 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	RAD9A	Q99638	391 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	ALG2	Q9H553	416 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	C6orf50	Q9HD87	102 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYB-223	ENST00000528140	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		6.57	□□□□□ -1.36

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