RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527871.5

RPS2-208, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 1 (best)

Gene RPS2, Length 1,243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	PLVAP	Q9BX97	442 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	C5orf42	Q9H799	3197 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	IFNAR1	P17181	557 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	GNA11	P29992	359 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	PAK2	Q13177	524 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	MGEA5	O60502	916 aa		27.61	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	C22orf31	O95567	290 aa		27.61	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		27.61	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	GATM	P50440	423 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	HYAL1	Q12794	435 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	PRR16	Q569H4	304 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	P2RX5	Q93086	422 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	MMP1	P03956	469 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	DNAJB1	P25685	340 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	PSMA5	P28066	241 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	GJD3	Q8N144	294 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	NCK2	O43639	380 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	GPR32	O75388	356 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	RPS6KA5	O75582	802 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	ITGB1	P05556	798 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	STAG3L1	P0CL83	205 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	CLDND1	Q9NY35	253 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	GINS2	Q9Y248	185 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-208	ENST00000527871	REC8	O95072	547 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	27.57	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	BICD2	Q8TD16	824 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	RGS18	Q9NS28	235 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871		C9IYK1	514 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	MSH4	O15457	936 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF862	O60290	1169 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	GPR37L1	O60883	481 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	PSAP	P07602	524 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	USP11	P51784	963 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	RUFY3	Q7L099	469 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	ADAM2	Q99965	735 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	FAM189B	P81408	668 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	FAM228A	Q86W67	206 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	VTN	P04004	478 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	DSC3	Q14574	896 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	SLC5A5	Q92911	643 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	OSMR	Q99650	979 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	WDR81	Q562E7	1941 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871		M0R2N6	131 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	GPR182	O15218	404 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	IRS1	P35568	1242 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	ADAM15	Q13444	863 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	RIT2	Q99578	217 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-208	ENST00000527871	DISC1	Q9NRI5	854 aa		27.53	■■■□□ 2

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