RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 COL1A2P08123 1366 aa19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 NID2Q14112 1375 aa19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB42B2RXF5 422 aa19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 PI4K2BG5E9Z4 385 aa19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 GNA11P29992 359 aa19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 LTBRP36941 435 aa19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 GATMP50440 423 aa19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 SETQ01105 290 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
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HERC3-211ENST00000513325 HYAL1Q12794 435 aa19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 NTRK3Q16288 839 aa19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 CKAP2LQ8IYA6 745 aa19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 FBXL16Q8N461 479 aa19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 AGXT2Q9BYV1 514 aa19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 LRFN2Q9ULH4 789 aa19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 PLAGL2Q9UPG8 496 aa19.2■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
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HERC3-211ENST00000513325 RPS6KA5O75582 802 aa19.19■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 MMP1P03956 469 aa19.19■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 CAMK1Q14012 370 aa19.19■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 PRR16Q569H4 304 aa19.19■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 TMEM40Q8WWA1 233 aa19.19■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 P2RX5Q93086 422 aa19.19■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R16BQ96T49 567 aa19.19■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 ERVK-5Q9HDB9 667 aa19.19■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 C11orf16Q9NQ32 467 aa19.19■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 FAM86C2PA6NEL3 165 aa19.18■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 MGEA5O60502 916 aa19.18■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 C22orf31O95567 290 aa19.18■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 ITGB1P05556 798 aa19.18■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 CIITAP33076 1130 aa19.18■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP19.18■□□□□ 0.66
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HERC3-211ENST00000513325 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 CTC1Q2NKJ3 1217 aa19.18■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 SLC26A6Q9BXS9 759 aa19.18■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 IGFLR1Q9H665 355 aa19.18■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa19.18■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa19.18■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 FAM50BQ9Y247 325 aa19.18■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa19.18■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa19.18■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa19.17■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 GPR37L1O60883 481 aa19.17■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 PSAPP07602 524 aa19.17■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 DNAJB1P25685 340 aa19.17■□□□□ 0.66
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HERC3-211ENST00000513325 CCDC148Q8NFR7 591 aa19.17■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 SPPL3Q8TCT6 385 aa19.17■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 BICD2Q8TD16 824 aa19.17■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 LENG9Q96B70 501 aa19.17■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 CCDC136Q96JN2 1154 aa19.17■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 ADAM2Q99965 735 aa19.17■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 VPS54Q9P1Q0 977 aa19.17■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 GABBR1Q9UBS5 961 aa19.17■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 SAMM50Q9Y512 469 aa19.17■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 DENND3A2RUS2 1198 aa19.16■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 GPR182O15218 404 aa19.16■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 EDIL3O43854 480 aa19.16■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 REC8O95072 547 aa19.16■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 VTNP04004 478 aa19.16■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 IFNAR1P17181 557 aa19.16■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 CLUL1Q15846 466 aa19.16■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 ODR4Q5SWX8 454 aa19.16■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 OSMRQ99650 979 aa19.16■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 RGS18Q9NS28 235 aa19.16■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 LINC01565O15544 149 aa19.15■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 IRS1P35568 1242 aa19.15■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 EVCP57679 992 aa19.15■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 ZP2Q05996 745 aa19.15■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 FAM102BQ5T8I3 360 aa19.15■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 SLC24A5Q71RS6 500 aa19.15■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 FAM228AQ86W67 206 aa19.15■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 C1orf112Q9NSG2 853 aa19.15■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 PRKAG3Q9UGI9 489 aa19.15■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 CEP131Q9UPN4 1083 aa19.15■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1671Q9BY89 1806 aa19.15■□□□□ 0.66
HERC3-211ENST00000513325 EVPLQ92817 2033 aa19.14■□□□□ 0.65
HERC3-211ENST00000513325 WDR64B1ANS9 1081 aa19.14■□□□□ 0.65
HERC3-211ENST00000513325 C9IYK1 514 aa19.14■□□□□ 0.65
HERC3-211ENST00000513325 MSH4O15457 936 aa19.14■□□□□ 0.65
HERC3-211ENST00000513325 TBX10O75333 385 aa19.14■□□□□ 0.65
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