RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 LYPLA2O95372 231 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 F2P00734 622 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 OATP04181 439 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 ASGR1P07306 291 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 SYKP43405 635 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 CHMP4BP1P59074 171 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 ECM1Q16610 540 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 GPR153Q6NV75 609 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 DNM3Q9UQ16 869 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 TRPC6Q9Y210 931 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 HPSEQ9Y251 543 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.41■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF862O60290 1169 aa22.41■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 PSEN2P49810 448 aa22.41■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 NDUFA8P51970 172 aa22.41■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 XKR3Q5GH77 459 aa22.41■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.41■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.41■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 IQUBQ8NA54 791 aa22.41■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 BADQ92934 168 aa22.41■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 DHX58Q96C10 678 aa22.41■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.41■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 STK17AQ9UEE5 414 aa22.41■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 CABYRO75952 493 aa22.4■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.4■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 MFSD10Q14728 455 aa22.4■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 PLCB4Q15147 1175 aa22.4■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.4■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.4■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SMIM20-201ENST00000506197 A0A087X0B3 334 aa22.39■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 E9PMD0 336 aa22.39■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 ATP4AP20648 1035 aa22.39■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.39■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.39■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.39■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 KAT2BQ92831 832 aa22.39■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.39■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 CUEDC2Q9H467 287 aa22.39■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.39■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 USP25Q9UHP3 1055 aa22.39■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.38■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.38■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 KIAA0355O15063 1070 aa22.38■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 HBP1O60381 514 aa22.38■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 XKR9Q5GH70 373 aa22.38■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 RAD54LQ92698 747 aa22.38■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 TOX2Q96NM4 488 aa22.38■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.38■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.38■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 A0A087WWV3 80 aa22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 HAS3O00219 553 aa22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF202O95125 648 aa22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 EYA4O95677 639 aa22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 MBD3O95983 291 aa22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 LIG1P18858 919 aa22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 PSMC6P62333 389 aa22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 E2F4Q16254 413 aa22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 ANO5Q75V66 913 aa22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 KCNK18Q7Z418 384 aa22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 DEFB123Q8N688 67 aa22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.37■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 KINO60870 393 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 STBD1O95210 358 aa22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 PLA2G4BP0C869 781 aa22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 RAG1P15918 1043 aa22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 ITGB8P26012 769 aa22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 FAAP100Q0VG06 881 aa22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 PPFIA1Q13136 1202 aa22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 MTERF2Q49AM1 385 aa22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 Q7L0L9 218 aa22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 C7orf31Q8N865 590 aa22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 CEP170P1Q96L14 293 aa22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 COL1A2P08123 1366 aa22.36■■□□□ 1.17
SMIM20-201ENST00000506197 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms