RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa28.1■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa28.1■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 FOSL2P15408 326 aa28.09■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 MCM7P33993 719 aa28.09■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 DEFB103AP81534 67 aa28.09■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 NCAPH2Q6IBW4 605 aa28.09■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 NRBP2Q9NSY0 501 aa28.09■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 EVPLQ92817 2033 aa28.09■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 SIP14410 1827 aa28.08■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 ZBTB42B2RXF5 422 aa28.08■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 CHRNA1P02708 482 aa28.08■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP28.08■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 CUL4AQ13619 759 aa28.08■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 MCTP1Q6DN14 999 aa28.08■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 BANK1Q8NDB2 785 aa28.08■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 ZBED2Q9BTP6 218 aa28.08■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CXCL3-202ENST00000502974 H3BQV1 296 aa28.07■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 TLL1O43897 1013 aa28.07■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 CA3P07451 260 aa28.07■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.07■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 M0QZ92 97 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 AMHP03971 560 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 TXKP42681 527 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 MGAT3Q09327 533 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF174Q15697 407 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 TTC38Q5R3I4 469 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 APBB2Q92870 758 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM60Q9H2L4 133 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 PCDHA12Q9UN75 941 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 CDY2AQ9Y6F7 541 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 CHD9Q3L8U1 2897 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 C22orf31O95567 290 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 GHRP10912 638 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 PSMC5P62195 406 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 SPIRE1Q08AE8 756 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM62Q0P6H9 643 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 IER5Q5VY09 327 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 MTMR9Q96QG7 549 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 OSBPL7Q9BZF2 842 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 PRDM12Q9H4Q4 367 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 TRAPPC10P48553 1259 aa28.04■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 EPHA7Q15375 998 aa28.04■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 XKR3Q5GH77 459 aa28.04■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa28.03■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 P4HBP07237 508 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 QARSP47897 775 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 NBR1Q14596 966 aa28.03■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP28.03■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 MYOCDQ8IZQ8 938 aa28.03■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 METTL13Q8N6R0 699 aa28.03■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 TRPV2Q9Y5S1 764 aa28.03■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM150BA6NC51 233 aa28.02■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 DDX11L8A8MPP1 907 aa28.02■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 GJB5O95377 273 aa28.02■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 LPIN1Q14693 890 aa28.02■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 MTERF2Q49AM1 385 aa28.02■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 FAM117BQ6P1L5 589 aa28.02■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 NME8Q8N427 588 aa28.02■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 DYDC2Q96IM9 177 aa28.02■■■□□ 2.08
CXCL3-202ENST00000502974 MAGEB2O15479 319 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP28.01■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 STBD1O95210 358 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 OR52Z1P0C646 297 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 FBXO47Q5MNV8 452 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 RAD9AQ99638 391 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 LXNQ9BS40 222 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 RGL1Q9NZL6 768 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 CLCN3P51790 818 aa28■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 CYP4A11Q02928 519 aa28■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa28■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 SH2D3AQ9BRG2 576 aa28■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 PLA2G4FQ68DD2 849 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 EFCAB12Q6NXP0 572 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 LRRC71Q8N4P6 559 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 USP38Q8NB14 1042 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 SLC17A8Q8NDX2 589 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 FOXD4L1Q9NU39 408 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL3-202ENST00000502974 CHD7Q9P2D1 2997 aa27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms