RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499601.2

AC008393.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC008393.1, Length 1,454 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008393.1-201ENST00000499601 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
AC008393.1-201ENST00000499601 KCNB1Q14721 858 aa20.52■□□□□ 0.88
AC008393.1-201ENST00000499601 ARSHQ5FYA8 562 aa20.52■□□□□ 0.88
AC008393.1-201ENST00000499601 PADI6Q6TGC4 694 aa20.52■□□□□ 0.88
AC008393.1-201ENST00000499601 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.52■□□□□ 0.88
AC008393.1-201ENST00000499601 UNC13DQ70J99 1090 aa20.52■□□□□ 0.88
AC008393.1-201ENST00000499601 DYMQ7RTS9 669 aa20.52■□□□□ 0.88
AC008393.1-201ENST00000499601 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
AC008393.1-201ENST00000499601 TRIM50Q86XT4 487 aa20.52■□□□□ 0.88
AC008393.1-201ENST00000499601 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.52■□□□□ 0.88
AC008393.1-201ENST00000499601 CEP170P1Q96L14 293 aa20.52■□□□□ 0.88
AC008393.1-201ENST00000499601 TIPINQ9BVW5 301 aa20.52■□□□□ 0.88
AC008393.1-201ENST00000499601 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
AC008393.1-201ENST00000499601 SLC34A2O95436 690 aa20.51■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 NKX3-2P78367 333 aa20.51■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.51■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.51■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.51■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.51■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 CYP26B1Q9NR63 512 aa20.51■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 ARID2Q68CP9 1835 aa20.51■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 TMEM150BA6NC51 233 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 KLRC4O43908 158 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 HBP1O60381 514 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 KPNA6O60684 536 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 GUCY2CP25092 1073 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 MARK3P27448 753 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 NPEPPSP55786 919 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 TYRO3Q06418 890 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 GIT2Q14161 759 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 PLCB4Q15147 1175 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 STX1AQ16623 288 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 EXOC1Q9NV70 894 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 H3BRB1 525 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 BIN1O00499 593 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 ZEB2O60315 1214 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 DGAT1O75907 488 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 ZNF286BP0CG31 522 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 IDEP14735 1019 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 NLRP12P59046 1061 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 REEP2Q9BRK0 252 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 ANO10Q9NW15 660 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 TRPC6Q9Y210 931 aa20.5■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 RHOBTB3O94955 611 aa20.49■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 MORC3Q14149 939 aa20.49■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 MTERF2Q49AM1 385 aa20.49■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.49■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.49■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 PANK4Q9NVE7 773 aa20.49■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 ADAMTS4O75173 837 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 F2P00734 622 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 RFC5P40937 340 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 LBX1P52954 281 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 BEX3Q00994 111 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 PSMD2Q13200 908 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 GNASQ5JWF2 1037 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 TSPY26PQ9H489 355 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.48■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 COL1A2P08123 1366 aa20.47■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 FAM13AO94988 1023 aa20.47■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 PGK1P00558 417 aa20.47■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 MYL3P08590 195 aa20.47■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 GAP43P17677 238 aa20.47■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.47■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 DRC1Q96MC2 740 aa20.47■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.47■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 CAVIN2O95810 425 aa20.46■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
AC008393.1-201ENST00000499601 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms