RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 COMTP21964 271 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 GDF5P43026 501 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 CD83Q01151 205 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.44e-7■■□□□ 12.5
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 SEC23AQ15436 765 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 C2orf27AQ580R0 203 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 FUKQ8N0W3 1084 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 SCLYQ96I15 445 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 OR14A2Q96R54 314 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 AMNQ9BXJ7 453 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 OR10A5Q9H207 317 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 A0A0G2JNJ9 132 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 RAD17O75943 681 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 NPTXRO95502 500 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 AMHP03971 560 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 TM4SF20Q53R12 229 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 AGBL4Q5VU57 503 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 KANK2Q63ZY3 851 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 USP30Q70CQ3 517 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 USP51Q70EK9 711 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF747Q9BV97 191 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 Q9UFV3 132 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 ASB1Q9Y576 335 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.28□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 MRE11P49959 708 aa6.28□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 IRF9Q00978 393 aa6.28□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 MOGSQ13724 837 aa6.28□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 PCOLCEQ15113 449 aa6.28□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM177Q53S58 311 aa6.28□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.28□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.28□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.28□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 JMYQ8N9B5 988 aa6.28□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 CALML6Q8TD86 181 aa6.28□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.28□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.28□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 FZD7O75084 574 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 KRT37O76014 449 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 MAP3K12Q12852 859 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 NFYCQ13952 458 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 TBR1Q16650 682 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 NRN1LQ496H8 165 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 DLG3Q92796 817 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 BOCQ9BWV1 1114 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 OR10A2Q9H208 303 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 RASSF10A6NK89 507 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 KCNQ2O43526 872 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 SDHAP31040 664 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 STAT5BP51692 787 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 EDAQ92838 391 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 FAM89AQ96GI7 184 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 MSL2Q9HCI7 577 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 B4E1Z4 1266 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 MATN2O00339 956 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 PLD2O14939 933 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 NFE2L2Q16236 605 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 Q8N1X5 172 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 LILRB2Q8N423 598 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.24□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 RAPGEF3O95398 923 aa6.24□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 KCNA6P17658 529 aa6.24□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.24□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.24□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 E2F7Q96AV8 911 aa6.24□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.24□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.24□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 M0R2C6 588 aa6.23□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 CYR61O00622 381 aa6.23□□□□□ -1.41
UBE2B-202ENST00000499038 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
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