RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 F8VZ95 297 aa12.95□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 THAP12O43422 761 aa12.95□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 PRLRP16471 622 aa12.95□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 SLC8A3P57103 927 aa12.95□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 ERP27Q96DN0 273 aa12.95□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 FAM118BQ9BPY3 351 aa12.95□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 FAM129AQ9BZQ8 928 aa12.95□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 MTFR1LQ9H019 292 aa12.95□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa12.95□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 HAO1Q9UJM8 370 aa12.95□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 TMEM120BA0PK00 339 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 STAT1P42224 750 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 PPP2R5BQ15173 497 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 DIXDC1Q155Q3 683 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 WLSQ5T9L3 541 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 CCDC65Q8IXS2 484 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 PPFIBP2Q8ND30 876 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 SUPT20HQ8NEM7 779 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 NHSL1Q5SYE7 1610 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 E9PMD0 336 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 RCN2Q14257 317 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 TMED2Q15363 201 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 RCSD1Q6JBY9 416 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 ISLR2Q6UXK2 745 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 ADGRA1Q86SQ6 560 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 CCHCR1Q8TD31 782 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 KDM4CQ9H3R0 1056 aa12.94□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 CFAP73A6NFT4 308 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 TOM1O60784 492 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 GNA11P29992 359 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 ALDH3A1P30838 453 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 XRCC4Q13426 336 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 SEL1L2Q5TEA6 688 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 LRIG3Q6UXM1 1119 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 SPATA21Q7Z572 469 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 TMC3Q7Z5M5 1100 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 NLRP10Q86W26 655 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 CEP72Q9P209 647 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 NR2E1Q9Y466 385 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 KLRC4O43908 158 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 TDP2O95551 362 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 ZCCHC18P0CG32 403 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 CCND1P24385 295 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 MEI1Q5TIA1 1274 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 NSMFQ6X4W1 530 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 STXBP3O00186 592 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 RFC5P40937 340 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 CYP2J2P51589 502 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 COPS2P61201 443 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 UBE2SQ16763 222 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 BARGINQ6ZT62 677 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 ETAA1Q9NY74 926 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 HDAC9Q9UKV0 1011 aa12.93□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 KIF3CO14782 793 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 GCNT3O95395 438 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 CREB1P16220 341 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 FECHP22830 423 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF76P36508 570 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 LRRC36Q1X8D7 754 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 CFAP157Q5JU67 520 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 C6orf118Q5T5N4 469 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 AGBL2Q5U5Z8 902 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 SYCP3Q8IZU3 236 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 C18orf8Q96DM3 657 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 CUEDC2Q9H467 287 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 PCDHA6Q9UN73 950 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 F8W031 263 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 OPHN1O60890 802 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 PPFIA2O75334 1257 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 GNAQP50148 359 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 PLCB3Q01970 1234 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 CHRNDQ07001 517 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 USP4Q13107 963 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 C6orf89Q6UWU4 347 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 SYCE1Q8N0S2 351 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 PIGSQ96S52 555 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 WDR17Q8IZU2 1322 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 ADCY8P40145 1251 aa12.92□□□□□ -0.34
PRRX1-207ENST00000497230 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms