RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495879.1

PTPRG-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRG, Length 3,011 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-207ENST00000495879 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 FUKQ8N0W3 1084 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 ABCA3Q99758 1704 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 LDHCP07864 332 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 SCTRP47872 440 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 IFNAR2P48551 515 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 REEP2Q9BRK0 252 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 GNA14O95837 355 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 RREB1Q92766 1687 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRG-207ENST00000495879 FAM196BA6NMK8 535 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 RHBDL3P58872 404 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 PRR16Q569H4 304 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 CUL5Q93034 780 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 FLOT1O75955 427 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 UFL1O94874 794 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 CCDC172P0C7W6 258 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 CCDC38Q502W7 563 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 HVCN1Q96D96 273 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 FAM212AQ96EL1 285 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 PSMD1Q99460 953 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 RPSAP08865 295 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 PALB2Q86YC2 1186 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 MYH4Q9Y623 1939 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 DDR1Q08345 913 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 SLC35G2Q8TBE7 412 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 SIX2Q9NPC8 291 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 GCNT3O95395 438 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 KRT13P13646 458 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 CHN1P15882 459 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 GPSM2P81274 684 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 BIRC3Q13489 604 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 SNCBQ16143 134 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 TATDN2Q93075 761 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 FMO2Q99518 471 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 CD209Q9NNX6 404 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 DRD4P21917 467 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 SCP2P22307 547 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 GIT2Q14161 759 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 EPHA7Q15375 998 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 MXD3Q9BW11 206 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 SLC12A3P55017 1021 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 COG2Q14746 738 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 NYXQ9GZU5 481 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 AZI2Q9H6S1 392 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 EVI5O60447 810 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 RDH13Q8NBN7 331 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 AMFRQ9UKV5 643 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 ZBTB39O15060 712 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 LRRN2O75325 713 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 NR3C1P04150 777 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF543Q08ER8 600 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 PPP1R7Q15435 360 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRG-207ENST00000495879 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms