RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 TPM3P06753 285 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 NPEPPSP55786 919 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC63Q05C16 580 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 SPAG1Q07617 926 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 CEP170P1Q96L14 293 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 SH2D3AQ9BRG2 576 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 THAP9Q9H5L6 903 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 STBD1O95210 358 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 ALDH1A1P00352 501 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 MAP2K5Q13163 448 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 FAM160B1Q5W0V3 765 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 NPLOC4Q8TAT6 608 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 SCFD1Q8WVM8 642 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 TSG101Q99816 390 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 TINF2Q9BSI4 451 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 TAPT1Q6NXT6 567 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 FOXR2Q6PJQ5 311 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA33Q96N06 139 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 CTAGE1Q96RT6 745 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 DEFB115Q30KQ5 88 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 MAEAQ7L5Y9 396 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 MAPK7Q13164 816 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 ODR4Q5SWX8 454 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 GPR20Q99678 358 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 AZI2Q9H6S1 392 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXB3-210ENST00000489475 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 KCNJ18B7U540 433 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 GCNT3O95395 438 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 STAT5BP51692 787 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 CASP5P51878 434 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 KCNJ12Q14500 433 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 HSDL1Q3SXM5 330 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 HS1BP3Q53T59 392 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 TCP11X2Q5H9J9 407 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 NELFCDQ8IXH7 590 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 FAM178BQ8IXR5 827 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 DAW1Q8N136 415 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 DRC1Q96MC2 740 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 KATNBL1Q9H079 304 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 CREBZFQ9NS37 354 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 OATP04181 439 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 AFAP1L1Q8TED9 768 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 COPS5Q92905 334 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 PCYT2Q99447 389 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 CYP26B1Q9NR63 512 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 RASSF10A6NK89 507 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 MYBP10242 640 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 IRF2BP1Q8IU81 584 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 CREBRFQ8IUR6 639 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 FAM114A1Q8IWE2 563 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 CAPNS2Q96L46 248 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 HOXC6P09630 235 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 ATP4AP20648 1035 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 SOCS4Q8WXH5 440 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 LAMC2Q13753 1193 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 FILIP1LQ4L180 1135 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 ZCWPW2Q504Y3 356 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM63BQ5T3F8 832 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 NRBP2Q9NSY0 501 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1B0GTH6 734 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 AOC2O75106 756 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 DGAT1O75907 488 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 GH1P01241 217 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 NMT1P30419 496 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 ADCYAP1R1P41586 468 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 ACVR2BQ13705 512 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 KRT31Q15323 416 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 BMT2Q1RMZ1 405 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 FAM102BQ5T8I3 360 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF507Q8TCN5 953 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 USP6NLQ92738 828 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 GLG1Q92896 1179 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 KCTD10Q9H3F6 313 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC10BA6NIK2 292 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 LGR5O75473 907 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 PLS3P13797 630 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-210ENST00000489475 YY1P25490 414 aa29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms