RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
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C9orf3-218ENST00000482056 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
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C9orf3-218ENST00000482056 H2AFZP0C0S5 128 aa16.78■□□□□ 0.28
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C9orf3-218ENST00000482056 SNAP25P60880 206 aa16.78■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 H2AFVQ71UI9 128 aa16.78■□□□□ 0.28
C9orf3-218ENST00000482056 ACTRT1Q8TDG2 376 aa16.78■□□□□ 0.28
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C9orf3-218ENST00000482056 TMEM59LQ9UK28 342 aa16.77■□□□□ 0.27
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C9orf3-218ENST00000482056 IQCKQ8N0W5 287 aa16.76■□□□□ 0.27
C9orf3-218ENST00000482056 LRRC57Q8N9N7 239 aa16.76■□□□□ 0.27
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C9orf3-218ENST00000482056 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.76■□□□□ 0.27
C9orf3-218ENST00000482056 ESYT3A0FGR9 886 aa16.75■□□□□ 0.27
C9orf3-218ENST00000482056 TMCO5BA8MYB1 307 aa16.75■□□□□ 0.27
C9orf3-218ENST00000482056 EBAG9O00559 213 aa16.75■□□□□ 0.27
C9orf3-218ENST00000482056 MAGEA9P43362 315 aa16.75■□□□□ 0.27
C9orf3-218ENST00000482056 GUCY2FP51841 1108 aa16.75■□□□□ 0.27
C9orf3-218ENST00000482056 CORO7P57737 925 aa16.75■□□□□ 0.27
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C9orf3-218ENST00000482056 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
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C9orf3-218ENST00000482056 GOLGA6L10A6NI86 522 aa16.75■□□□□ 0.27
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C9orf3-218ENST00000482056 FAM153BP0C7A2 387 aa16.75■□□□□ 0.27
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C9orf3-218ENST00000482056 CASP4P49662 377 aa16.75■□□□□ 0.27
C9orf3-218ENST00000482056 FAM153CQ494X1 144 aa16.75■□□□□ 0.27
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C9orf3-218ENST00000482056 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa16.75■□□□□ 0.27
C9orf3-218ENST00000482056 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
C9orf3-218ENST00000482056 ATRNL1Q5VV63 1379 aa16.74■□□□□ 0.27
C9orf3-218ENST00000482056 EML1O00423 815 aa16.74■□□□□ 0.27
C9orf3-218ENST00000482056 TRIM66O15016 1216 aa16.74■□□□□ 0.27
C9orf3-218ENST00000482056 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
C9orf3-218ENST00000482056 STAT2P52630 851 aa16.74■□□□□ 0.27
C9orf3-218ENST00000482056 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
C9orf3-218ENST00000482056 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
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