RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473270.1

APTX-218, Transcript of aprataxin, humanhuman

TSL 2

Gene APTX, Length 645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTX-218ENST00000473270 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.15■■□□□ 1.14
APTX-218ENST00000473270 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.15■■□□□ 1.14
APTX-218ENST00000473270 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.14■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 CPLX1O14810 134 aa22.14■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 HBP1O60381 514 aa22.14■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 PFKFB2O60825 505 aa22.14■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.14■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.13■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 ZP2Q05996 745 aa22.13■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 HYAL1Q12794 435 aa22.13■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 COL19A1Q14993 1142 aa22.13■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 MCTP2Q6DN12 878 aa22.13■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.13■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.13■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.13■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.13■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 CD207Q9UJ71 328 aa22.13■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.13■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 RPS6KA5O75582 802 aa22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 ARP10275 920 aa22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 KLRC1P26715 233 aa22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 CDC27P30260 824 aa22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 ME3Q16798 604 aa22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 PGBD1Q96JS3 809 aa22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 PCYT2Q99447 389 aa22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 BARHL2Q9NY43 387 aa22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.11■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 FSD2A1L4K1 749 aa22.11■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 GPR182O15218 404 aa22.11■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 CDKL5O76039 1030 aa22.11■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 SREBF1P36956 1147 aa22.11■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.11■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.11■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.11■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 ZNF302Q9NR11 478 aa22.11■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.11■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.1■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 STXBP3O00186 592 aa22.1■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 MEIS1O00470 390 aa22.1■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 SCRN1Q12765 414 aa22.1■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.1■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.1■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.1■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 COL1A2P08123 1366 aa22.1■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 MBTPS2O43462 519 aa22.09■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 PPFIA3O75145 1194 aa22.09■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.09■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 IFNAR1P17181 557 aa22.09■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 LTBRP36941 435 aa22.09■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.09■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.09■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 METTL13Q8N6R0 699 aa22.09■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 POF1BQ8WVV4 589 aa22.09■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 GTF3C6Q969F1 213 aa22.09■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 C6orf50Q9HD87 102 aa22.09■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.09■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 ATG7O95352 703 aa22.08■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 ITGB1P05556 798 aa22.08■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 ADAM15Q13444 863 aa22.08■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.08■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.08■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 NECAB1Q8N987 351 aa22.08■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.08■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.08■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.08■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.08■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.08■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 SAMM50Q9Y512 469 aa22.08■■□□□ 1.13
APTX-218ENST00000473270 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.07■■□□□ 1.12
APTX-218ENST00000473270 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.07■■□□□ 1.12
APTX-218ENST00000473270 LARGE1O95461 756 aa22.07■■□□□ 1.12
APTX-218ENST00000473270 PSAPP07602 524 aa22.07■■□□□ 1.12
APTX-218ENST00000473270 LINC00271P0C7V0 271 aa22.07■■□□□ 1.12
APTX-218ENST00000473270 TMOD1P28289 359 aa22.07■■□□□ 1.12
APTX-218ENST00000473270 GNA11P29992 359 aa22.07■■□□□ 1.12
APTX-218ENST00000473270 NRIP1P48552 1158 aa22.07■■□□□ 1.12
APTX-218ENST00000473270 UBE3AQ05086 875 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms