RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463006.5

CNOT10-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 3

Gene CNOT10, Length 692 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-208	ENST00000463006	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	DSE	Q9UL01	958 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	LAMTOR5	O43504	91 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	NPTXR	O95502	500 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	MTMR1	Q13613	665 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	BRD3	Q15059	726 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	PTPRN2	Q92932	1015 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	NUDT11	Q96G61	164 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	ALG1	Q9BT22	464 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	KCND1	Q9NSA2	647 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	ARVCF	O00192	962 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	GPR39	O43194	453 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	BRINP1	O60477	761 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	KNG1	P01042	644 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	CKM	P06732	381 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	ITK	Q08881	620 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	DHCR24	Q15392	516 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	C4orf46	Q504U0	113 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	CD244	Q9BZW8	370 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	CDH19	Q9H159	772 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF839	A8K0R7	811 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	AQP7	O14520	342 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	IL18BP	O95998	194 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	CHGB	P05060	677 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	NEK4	P51957	841 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	EPHB4	P54760	987 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	PFKP	Q01813	784 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	NFATC3	Q12968	1075 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	PAK1	Q13153	545 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	STAT4	Q14765	748 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	SURF1	Q15526	300 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	C14orf80	Q86SX3	495 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	PASD1	Q8IV76	773 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	BORCS6	Q96GS4	357 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM83G	A6ND36	823 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	GPR42	O15529	346 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	EFCAB14	O75071	495 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	ASL	P04424	464 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	AMY2A	P04746	511 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF20	P17024	532 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	AMY2B	P19961	511 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	NXN	Q6DKJ4	435 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	BRAP	Q7Z569	592 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	TTC8	Q8TAM2	541 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	HOOK2	Q96ED9	719 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	LOXL4	Q96JB6	756 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	C8orf49	Q96NF6	230 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF536	O15090	1300 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNOT10-208	ENST00000463006	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms