RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 SLITRK5O94991 958 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 CA3P07451 260 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 CCL14Q16627 93 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 LILRA6Q6PI73 481 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 MFSD4AQ8N468 514 aa6.19□□□□□ -1.42
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RABGGTB-203ENST00000459697 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 PLXNB2O15031 1838 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 FBXO24O75426 580 aa6.18□□□□□ -1.42
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RABGGTB-203ENST00000459697 MYL6BP14649 208 aa6.18□□□□□ -1.42
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RABGGTB-203ENST00000459697 FGD1P98174 961 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 DSC3Q14574 896 aa6.18□□□□□ -1.42
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RABGGTB-203ENST00000459697 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 MIPEPQ99797 713 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 MSCO60682 206 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
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RABGGTB-203ENST00000459697 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 CEP250Q9BV73 2442 aa6.17□□□□□ -1.42
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RABGGTB-203ENST00000459697 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
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RABGGTB-203ENST00000459697 LPXNO60711 386 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 CBX7O95931 251 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 KRT1P04264 644 aa6.16□□□□□ -1.42
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RABGGTB-203ENST00000459697 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 INPP5AQ14642 412 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRC41Q15345 812 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 HDXQ7Z353 690 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM199Q8N511 208 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 IL17REQ8NFR9 667 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 UBE2FQ969M7 185 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 FBRSQ9HAH7 460 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 XDHP47989 1333 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.15□□□□□ -1.42
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RABGGTB-203ENST00000459697 TREHO43280 583 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 FGBP02675 491 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 PROS1P07225 676 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 RAC2P15153 192 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 SDHBP21912 280 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 MAPK1P28482 360 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 PDE4CQ08493 712 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 TTC6Q86TZ1 520 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 DCLK2Q8N568 766 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 RIN3Q8TB24 985 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 ABHD4Q8TB40 342 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 NEK9Q8TD19 979 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.15□□□□□ -1.42
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