RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		12.35	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	ZBBX	A8MT70	800 aa		12.35	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		12.35	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		12.35	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	TTC38	Q5R3I4	469 aa		12.35	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	TIFA	Q96CG3	184 aa		12.35	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		12.35	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		12.35	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		12.35	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		12.35	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	GJB2	P29033	226 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	PRPH	P41219	470 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	IGBP1	P78318	339 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	RAB34	Q9BZG1	259 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160		H3BQV1	296 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	CHMP2A	O43633	222 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	BMP15	O95972	392 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	CHRNA1	P02708	482 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	OR52Z1	P0C646	297 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	DNM2	P50570	870 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	MBTPS1	Q14703	1052 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	SAMD11	Q96NU1	681 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	BRAP	Q7Z569	592 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	LRCH3	Q96II8	777 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		12.34	□□□□□ -0.43
UBXN7-205	ENST00000429160	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		12.33	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	STBD1	O95210	358 aa		12.33	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	DNAJB2	P25686	324 aa		12.33	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		12.33	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	TCP11	Q8WWU5	503 aa		12.33	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		12.33	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF862	O60290	1169 aa		12.33	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	12.33	□□□□□ -0.44	7e-6	■■□□□ 13.4
UBXN7-205	ENST00000429160	LPIN1	Q14693	890 aa		12.33	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		12.33	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF410	Q86VK4	478 aa		12.33	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		12.33	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	GPR182	O15218	404 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	PDIA5	Q14554	519 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	UGCG	Q16739	394 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	DEFB123	Q8N688	67 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	PBX4	Q9BYU1	374 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM205C	A6NFA0	338 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	ASAP2	O43150	1006 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	FOSB	P53539	338 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	PAK2	Q13177	524 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	12.32	□□□□□ -0.44	4e-12	■■□□□ 14.3
UBXN7-205	ENST00000429160	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	CTSH	P09668	335 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	GUCY1B3	Q02153	619 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	CEP89	Q96ST8	783 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	RAD9A	Q99638	391 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		12.32	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		12.31	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	EML1	O00423	815 aa		12.31	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	STAG3L1	P0CL83	205 aa		12.31	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	LXN	Q9BS40	222 aa		12.31	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		12.31	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		12.31	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	MCM7	P33993	719 aa		12.31	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	BANK1	Q8NDB2	785 aa		12.31	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		12.31	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	INSL6	Q9Y581	213 aa		12.31	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
UBXN7-205	ENST00000429160	DYDC2	Q96IM9	177 aa		12.3	□□□□□ -0.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms