RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
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FAAP20-209ENST00000428120 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25.53■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC53A6NM62 1247 aa25.53■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 KIF5CO60282 957 aa25.53■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP25P42331 645 aa25.53■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 SP4Q02446 784 aa25.53■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 KCNH2Q12809 1159 aa25.53■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 NLRX1Q86UT6 975 aa25.53■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 NLRC4Q9NPP4 1024 aa25.53■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM10Q9UDY6 481 aa25.53■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 WDR64B1ANS9 1081 aa25.52■■□□□ 1.68
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FAAP20-209ENST00000428120 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 SEL1LQ9UBV2 794 aa25.52■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa25.52■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 PLA2G4FQ68DD2 849 aa25.52■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa25.52■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 IQCDQ96DY2 449 aa25.52■■□□□ 1.68
FAAP20-209ENST00000428120 BACH1O14867 736 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 HERVK_113P62684 666 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 KRT76Q01546 638 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF569Q5MCW4 686 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 BAP1Q92560 729 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 GPRASP2Q96D09 838 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 BTBD7Q9P203 1132 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 PLAGL2Q9UPG8 496 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 MYPNQ86TC9 1320 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 RPL13P26373 211 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 JAK3P52333 1124 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 FRMD5Q7Z6J6 570 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 CDCA5Q96FF9 252 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 FAM184BQ9ULE4 1060 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 NOL4O94818 638 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 NPEPPSP55786 919 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 CNTN2Q02246 1040 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 TCERG1LQ5VWI1 586 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 K7ENM7 598 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 KCNA2P16389 499 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 PSMC5P62195 406 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 CYP27A1Q02318 531 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 GPRC5CQ9NQ84 441 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 FSTL1Q12841 308 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 GUCA1BQ9UMX6 200 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 LYPLA2O95372 231 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 EPB41P11171 864 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 SFNP31947 248 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 LBX2Q6XYB7 198 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 C4orf19Q8IY42 314 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 ERO1AQ96HE7 468 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC42Q96M95 316 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 EPHX2P34913 555 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 XKR9Q5GH70 373 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 LCTP09848 1927 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 CYP2J2P51589 502 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 PDXDC1Q6P996 788 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 SLC35F6Q8N357 371 aa25.47■■□□□ 1.67
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FAAP20-209ENST00000428120 CDK17Q00537 523 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 HS2ST1Q7LGA3 356 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC170Q8IYT3 715 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 GBP3Q9H0R5 595 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 GABBR1Q9UBS5 961 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF263O14978 683 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 ACTN1P12814 892 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 ANO5Q75V66 913 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA1328Q86T90 577 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 SYCP3Q8IZU3 236 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 CEP72Q9P209 647 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 RCCD1A6NED2 376 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 MAFGO15525 162 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 KRT83P78385 493 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
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