RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ITPK1	Q13572	414 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM182B	Q5T319	152 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IQCD	Q96DY2	449 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDP2	Q9P2J9	529 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GDA	Q9Y2T3	454 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAST3	O60307	1309 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DAPK3	O43293	454 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AKR1B10	O60218	316 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CEP104	O60308	925 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ENTPD5	O75356	428 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EXOC1	Q9NV70	894 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GRM8	O00222	908 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PALM	O75781	387 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GJB6	O95452	261 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SKI	P12755	728 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SESN3	P58005	492 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NR5A1	Q13285	461 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NTRK3	Q16288	839 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PARP6	Q2NL67	630 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM110	Q86TL2	294 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM81B	Q96LP2	452 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59	4e-6	■■■□□ 15.4
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	XDH	P47989	1333 aa		11.34	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PJA2	O43164	708 aa		11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAPN15	O75808	1086 aa		11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCA5L	O95447	670 aa		11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ASL	P04424	464 aa		11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAT1	P18440	290 aa		11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PHEX	P78562	749 aa		11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EHHADH	Q08426	723 aa		11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC80	Q76M96	950 aa		11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMC4	Q7Z404	712 aa		11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLF2	Q8IX21	1173 aa		11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NCOA7	Q8NI08	942 aa		11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		11.33	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYH1	P12882	1939 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMIM23	A6NLE4	172 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GUCY1A2	P33402	732 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MICU3	Q86XE3	530 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DPH5	Q9H2P9	285 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STK36	Q9NRP7	1315 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A0J9YVX5	310 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FGA	P02671	866 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MMP1	P03956	469 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ITGA2B	P08514	1039 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VHL	P40337	213 aa		11.33	□□□□□ -0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms