RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-208	ENST00000420964	ISM2	Q6H9L7	571 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PADI6	Q6TGC4	694 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	UNC13D	Q70J99	1090 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	REEP2	Q9BRK0	252 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964		Q9Y3F1	56 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	SEPT4	O43236	478 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	IDE	P14735	1019 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	MARK3	P27448	753 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC26A2	P50443	739 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	NPEPPS	P55786	919 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	CEP170P1	Q96L14	293 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	MYH11	P35749	1972 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964		A6NJR5	290 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	PPFIA4	O75335	1185 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	RHOBTB3	O94955	611 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	BMP6	P22004	513 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	GUCY2C	P25092	1073 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	CNGA1	P29973	690 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	CPT1A	P50416	773 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	COASY	Q13057	564 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	GIT2	Q14161	759 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	PLCB4	Q15147	1175 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	DGKD	Q16760	1214 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	PANK4	Q9NVE7	773 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	CAVIN2	O95810	425 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	INHA	P05111	366 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	RSPH10B	P0C881	870 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	RARB	P10826	455 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	EHHADH	Q08426	723 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	GSE1	Q14687	1217 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	MTERF2	Q49AM1	385 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	MLKL	Q8NB16	471 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	DACH1	Q9UI36	760 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		13.68	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	HIP1R	O75146	1068 aa		13.67	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	DGAT1	O75907	488 aa		13.67	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM13A	O94988	1023 aa		13.67	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	GAP43	P17677	238 aa		13.67	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	GRK4	P32298	578 aa		13.67	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	EMC2	Q15006	297 aa		13.67	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		13.67	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	SFR1	Q86XK3	245 aa		13.67	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		13.67	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		13.67	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.67	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	PPME1	Q9Y570	386 aa		13.67	□□□□□ -0.22
FAAP20-208	ENST00000420964	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		13.67	□□□□□ -0.22

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