RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 STBD1O95210 358 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 C22orf31O95567 290 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 GHRP10912 638 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.396e-14■■■■■ 28.4
SH3BP4-204ENST00000416021 TXKP42681 527 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 LPIN1Q14693 890 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF174Q15697 407 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 METTL13Q8N6R0 699 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 MYOGP15173 224 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO47Q5MNV8 452 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 TRPV2Q9Y5S1 764 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFB103AP81534 67 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 APBB2Q92870 758 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF576Q9H609 170 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 RGL1Q9NZL6 768 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAPPC10P48553 1259 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CUL4AQ13619 759 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SQORQ9Y6N5 450 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TET1Q8NFU7 2136 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 KAT6AQ92794 2004 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM150BA6NC51 233 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 H3BQV1 296 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TMOD1P28289 359 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 MTERF2Q49AM1 385 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC38Q5R3I4 469 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 MCTP1Q6DN14 999 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ANO5Q75V66 913 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 USP38Q8NB14 1042 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 DYDC2Q96IM9 177 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CDHR5Q9HBB8 845 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 GINS2Q9Y248 185 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SLITRK3O94933 977 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 AMHP03971 560 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CLCN3P51790 818 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TPH2Q8IWU9 490 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 GUCD1Q96NT3 240 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP89Q96ST8 783 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TANC1Q9C0D5 1861 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TLL1O43897 1013 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 VTNP04004 478 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CD52P31358 61 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 GRIN2CQ14957 1233 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 C4orf19Q8IY42 314 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 LXNQ9BS40 222 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 AKT3Q9Y243 479 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ENPP3O14638 875 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR32O75388 356 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TECP42680 631 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP4A11Q02928 519 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 NBR1Q14596 966 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 KIZQ2M2Z5 673 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP7D2Q96T17 732 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R16BQ96T49 567 aa23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms