RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 SREBF1P36956 1147 aa21.98■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 SLC26A2P50443 739 aa21.98■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 AP3B2Q13367 1082 aa21.98■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 SWSAP1Q6NVH7 229 aa21.98■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.98■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.98■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 ADAM2Q99965 735 aa21.98■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 CDHR5Q9HBB8 845 aa21.98■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.98■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 C5orf42Q9H799 3197 aa21.97■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 MEIS1O00470 390 aa21.97■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 KIZQ2M2Z5 673 aa21.97■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.97■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.97■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.97■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 METTL13Q8N6R0 699 aa21.97■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 EFHBQ8N7U6 833 aa21.97■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 OSMRQ99650 979 aa21.97■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 TLE6Q9H808 572 aa21.97■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.97■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 BARHL2Q9NY43 387 aa21.97■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.97■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.97■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.96■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 PER2O15055 1255 aa21.96■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 ATG7O95352 703 aa21.96■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.96■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 SKAP1Q86WV1 359 aa21.96■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.96■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 CRIPAKQ8N1N5 446 aa21.96■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.96■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.96■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 AAASQ9NRG9 546 aa21.96■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 CLEC1BQ9P126 229 aa21.96■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 HCSTQ9UBK5 93 aa21.96■■□□□ 1.11
UBXN4-202ENST00000415164 FAM86B1E9PN63 330 aa21.95■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 GPR182O15218 404 aa21.95■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.95■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 CDC27P30260 824 aa21.95■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.95■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 ODR4Q5SWX8 454 aa21.95■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 MSLNLQ96KJ4 702 aa21.95■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 FBXL18Q96ME1 805 aa21.95■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.95■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.95■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 MUC6Q6W4X9 2439 aa21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 VTNP04004 478 aa21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 FGFR1P11362 822 aa21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 FUT2Q10981 343 aa21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 TLR9Q9NR96 1032 aa21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 RGS18Q9NS28 235 aa21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 SAMM50Q9Y512 469 aa21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 COL1A2P08123 1366 aa21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.94■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 FGF18O76093 207 aa21.93■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 GLP2RO95838 553 aa21.93■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 SLC24A5Q71RS6 500 aa21.93■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.93■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 SMRP1Q8NCR6 262 aa21.93■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa21.93■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 EYA4O95677 639 aa21.92■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 MRE11P49959 708 aa21.92■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 NHLH1Q02575 133 aa21.92■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 APOBRQ0VD83 1088 aa21.92■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.92■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 FAM228AQ86W67 206 aa21.92■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 RASEFQ8IZ41 740 aa21.92■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.92■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 AKT3Q9Y243 479 aa21.92■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 C22orf31O95567 290 aa21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 CPA1P15085 419 aa21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 ATP4AP20648 1035 aa21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 CLCN3P51790 818 aa21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 COASYQ13057 564 aa21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 KRT32Q14532 448 aa21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 PRR16Q569H4 304 aa21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 RNF169Q8NCN4 708 aa21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms