RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP5-204ENST00000412806 STXBP2Q15833 593 aa23.8■■□□□ 1.4
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SH3BP5-204ENST00000412806 KSR1Q8IVT5 923 aa23.78■■□□□ 1.4
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SH3BP5-204ENST00000412806 Q3C1V9 767 aa23.77■■□□□ 1.4
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SH3BP5-204ENST00000412806 ACTR2P61160 394 aa23.75■■□□□ 1.39
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SH3BP5-204ENST00000412806 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5-204ENST00000412806 IQCDQ96DY2 449 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5-204ENST00000412806 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5-204ENST00000412806 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.74■■□□□ 1.39
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