RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 SMPD1P17405 629 aa22.35■■□□□ 1.17
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ODC1-202ENST00000405333 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.35■■□□□ 1.17
ODC1-202ENST00000405333 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ODC1-202ENST00000405333 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ODC1-202ENST00000405333 RGS2P41220 211 aa22.35■■□□□ 1.17
ODC1-202ENST00000405333 MAPK7Q13164 816 aa22.35■■□□□ 1.17
ODC1-202ENST00000405333 RNF186Q9NXI6 227 aa22.35■■□□□ 1.17
ODC1-202ENST00000405333 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.35■■□□□ 1.17
ODC1-202ENST00000405333 HIP1RO75146 1068 aa22.34■■□□□ 1.17
ODC1-202ENST00000405333 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
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ODC1-202ENST00000405333 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.34■■□□□ 1.17
ODC1-202ENST00000405333 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ODC1-202ENST00000405333 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.34■■□□□ 1.17
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ODC1-202ENST00000405333 APBA2Q99767 749 aa22.34■■□□□ 1.17
ODC1-202ENST00000405333 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.34■■□□□ 1.17
ODC1-202ENST00000405333 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.34■■□□□ 1.17
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ODC1-202ENST00000405333 PSMD2Q13200 908 aa22.33■■□□□ 1.17
ODC1-202ENST00000405333 CEP170P1Q96L14 293 aa22.33■■□□□ 1.17
ODC1-202ENST00000405333 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.33■■□□□ 1.17
ODC1-202ENST00000405333 FAM13AO94988 1023 aa22.33■■□□□ 1.16
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ODC1-202ENST00000405333 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 SPATA1Q5VX52 437 aa22.33■■□□□ 1.16
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ODC1-202ENST00000405333 OATP04181 439 aa22.32■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 MYBP10242 640 aa22.32■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 STIM1Q13586 685 aa22.32■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 MTERF2Q49AM1 385 aa22.32■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.32■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 MYCT1Q8N699 235 aa22.32■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 AFG1LQ8WV93 481 aa22.32■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.32■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
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ODC1-202ENST00000405333 IGHA2P01877 340 aa22.31■■□□□ 1.16
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ODC1-202ENST00000405333 ZNF18P17022 549 aa22.31■■□□□ 1.16
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ODC1-202ENST00000405333 PRKCZQ05513 592 aa22.31■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 XKR3Q5GH77 459 aa22.31■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 TTI2Q6NXR4 508 aa22.31■■□□□ 1.16
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ODC1-202ENST00000405333 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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ODC1-202ENST00000405333 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.31■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.31■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 P2RX5Q93086 422 aa22.31■■□□□ 1.16
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ODC1-202ENST00000405333 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
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ODC1-202ENST00000405333 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.161e-323■■■■■ 34.4
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ODC1-202ENST00000405333 LAMC2Q13753 1193 aa22.3■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.3■■□□□ 1.16
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ODC1-202ENST00000405333 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.3■■□□□ 1.16
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ODC1-202ENST00000405333 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.29■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 SARM1Q6SZW1 724 aa22.29■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 KSR1Q8IVT5 923 aa22.29■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.29■■□□□ 1.16
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ODC1-202ENST00000405333 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.29■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 CENPPQ6IPU0 288 aa22.29■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 TRIB2Q92519 343 aa22.29■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 CEP89Q96ST8 783 aa22.29■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.29■■□□□ 1.16
ODC1-202ENST00000405333 ZNF286BP0CG31 522 aa22.28■■□□□ 1.16
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