RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396779.7

TIMM17B-202, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TIMM17B, Length 1,099 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-202ENST00000396779 EPHB4P54760 987 aa19.23■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa19.23■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 LRCH3Q96II8 777 aa19.23■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 LRWD1Q9UFC0 647 aa19.23■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 PPME1Q9Y570 386 aa19.23■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 SCN5AQ14524 2016 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 EVPLQ92817 2033 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 LYPLA2O95372 231 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 FGBP02675 491 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 ACRP10323 421 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 YWHABP31946 246 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 FAM26DQ5JW98 314 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 TMEM240Q5SV17 173 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 IER5Q5VY09 327 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 HAUS3Q68CZ6 603 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 TRAF7Q6Q0C0 670 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 ANO5Q75V66 913 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 C16orf59Q7L2K0 433 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 DEFB128Q7Z7B8 93 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 EXOC8Q8IYI6 725 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 METTL13Q8N6R0 699 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 IGSF22Q8N9C0 903 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 ZBTB10Q96DT7 871 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 TUFT1Q9NNX1 390 aa19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 M0QZ92 97 aa19.21■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 CTSHP09668 335 aa19.21■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 RPA1P27694 616 aa19.21■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 TMOD1P28289 359 aa19.21■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 SHHQ15465 462 aa19.21■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 MTERF2Q49AM1 385 aa19.21■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 ZNF365Q70YC5 407 aa19.21■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP19.21■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP19.21■□□□□ 0.674e-7■■□□□ 12.3
TIMM17B-202ENST00000396779 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 CYP26B1Q9NR63 512 aa19.21■□□□□ 0.67
TIMM17B-202ENST00000396779 CXCL10P02778 98 aa19.2■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa19.2■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 ACTN1P12814 892 aa19.2■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP19.2■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 MUTP22033 750 aa19.2■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 C9orf50Q5SZB4 431 aa19.2■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 EFCAB12Q6NXP0 572 aa19.2■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 CATSPER3Q86XQ3 398 aa19.2■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa19.2■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 ZNF710Q8N1W2 664 aa19.2■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 CEP170P1Q96L14 293 aa19.2■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 ANKEF1Q9NU02 776 aa19.2■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 TMEM150BA6NC51 233 aa19.19■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 NBNO60934 754 aa19.19■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 CHRNA1P02708 482 aa19.19■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 DNM2P50570 870 aa19.19■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 MBTPS1Q14703 1052 aa19.19■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 GPNMBQ14956 572 aa19.19■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 IL17AQ16552 155 aa19.19■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 XKR9Q5GH70 373 aa19.19■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 PLA2G4FQ68DD2 849 aa19.19■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 HERVK_113Q902F9 699 aa19.19■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 VWCEQ96DN2 955 aa19.19■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 CEP89Q96ST8 783 aa19.19■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 MAP7D2Q96T17 732 aa19.19■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 CDY2AQ9Y6F7 541 aa19.19■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 TET1Q8NFU7 2136 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 VWA3AA6NCI4 1184 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 MAFO75444 373 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 MED24O75448 989 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 RFC5P40937 340 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 NPEPPSP55786 919 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 MGAT3Q09327 533 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 KRT79Q5XKE5 535 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 GPR153Q6NV75 609 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 FAM173BQ6P4H8 233 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 LINC01465Q8N7H1 131 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 SLC7A3Q8WY07 619 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 NACC1Q96RE7 527 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 SH2D3AQ9BRG2 576 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 SUGCTQ9HAC7 445 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 TRPV2Q9Y5S1 764 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 CLIC4Q9Y696 253 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 SQORQ9Y6N5 450 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa19.18■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa19.17■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 F13A1P00488 732 aa19.17■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 CLCN3P51790 818 aa19.17■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
TIMM17B-202ENST00000396779 CDC42EP1Q00587 391 aa19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms