RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 LGR5O75473 907 aa22.57■■□□□ 1.2
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TMCO3-201ENST00000375391 A6NJR5 290 aa22.55■■□□□ 1.2
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TMCO3-201ENST00000375391 SEPT4O43236 478 aa22.55■■□□□ 1.2
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TMCO3-201ENST00000375391 SLC26A4O43511 780 aa22.55■■□□□ 1.2
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TMCO3-201ENST00000375391 XKR3Q5GH77 459 aa22.55■■□□□ 1.2
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TMCO3-201ENST00000375391 IGBP1P78318 339 aa22.54■■□□□ 1.2
TMCO3-201ENST00000375391 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.54■■□□□ 1.2
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TMCO3-201ENST00000375391 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.54■■□□□ 1.2
TMCO3-201ENST00000375391 KAT2BQ92831 832 aa22.54■■□□□ 1.2
TMCO3-201ENST00000375391 PANK4Q9NVE7 773 aa22.54■■□□□ 1.2
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TMCO3-201ENST00000375391 NLRP12P59046 1061 aa22.54■■□□□ 1.2
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TMCO3-201ENST00000375391 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.53■■□□□ 1.2
TMCO3-201ENST00000375391 MYL3P08590 195 aa22.52■■□□□ 1.2
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TMCO3-201ENST00000375391 STX1AQ16623 288 aa22.52■■□□□ 1.2
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TMCO3-201ENST00000375391 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.52■■□□□ 1.2
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TMCO3-201ENST00000375391 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
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TMCO3-201ENST00000375391 HIC1Q14526 733 aa22.52■■□□□ 1.2
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TMCO3-201ENST00000375391 KSR1Q8IVT5 923 aa22.52■■□□□ 1.2
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TMCO3-201ENST00000375391 ADAMTS4O75173 837 aa22.51■■□□□ 1.19
TMCO3-201ENST00000375391 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
TMCO3-201ENST00000375391 INSRRP14616 1297 aa22.51■■□□□ 1.19
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