RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 MYO19Q96H55 970 aa7.91□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC42Q96M95 316 aa7.91□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 CSRNP1Q96S65 589 aa7.91□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 PIF1Q9H611 641 aa7.91□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 VEZTQ9HBM0 779 aa7.91□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 CABP5Q9NP86 173 aa7.91□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa7.91□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 ABCB11O95342 1321 aa7.91□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD62A6NC57 917 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 FAM107AO95990 144 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 IL1R1P14778 569 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 TDO2P48775 406 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 TREML1Q86YW5 311 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA4Q8NEY3 305 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 CAPZA3Q96KX2 299 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 UBAC1Q9BSL1 405 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 EDEM3Q9BZQ6 932 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 COA1Q9GZY4 146 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 KLC4Q9NSK0 619 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 AK5Q9Y6K8 562 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF532Q9HCE3 1301 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 ENC1O14682 589 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 RPN1P04843 607 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CALML3P27482 149 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ELF1P32519 619 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 LSP1P33241 339 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 FNTAP49354 379 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 HERVK_113P62684 666 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 GSTO1P78417 241 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 BIRC3Q13489 604 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CRYMQ14894 314 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SNCBQ16143 134 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 TTC38Q5R3I4 469 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 KCNV1Q6PIU1 500 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ADSSL1Q8N142 457 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEB6Q8N7X4 407 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 TTLL6Q8N841 843 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 KAT2BQ92831 832 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CHP1Q99653 195 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CD209Q9NNX6 404 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ABCF2Q9UG63 623 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SWAP70Q9UH65 585 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SUFUQ9UMX1 484 aa7.9□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SLX4Q8IY92 1834 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 LAD1O00515 517 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CES2O00748 559 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CDK2AP1O14519 115 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 LCA5LO95447 670 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 LDHCP07864 332 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 NR1D1P20393 614 aa7.89□□□□□ -1.15
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CTPS1-201ENST00000372616 GRIN1Q05586 938 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC96Q2M329 555 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 WLSQ5T9L3 541 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CREG2Q8IUH2 290 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ESR2Q92731 530 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC45Q96CN5 670 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM47Q96LD4 638 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ERGIC2Q96RQ1 377 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
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