RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.17■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 CETN3O15182 167 aa26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 CLSTN1O94985 981 aa26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 VEZTQ9HBM0 779 aa26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 A6NNZ2 444 aa26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 UBXN2AP68543 259 aa26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 TUBB8Q3ZCM7 444 aa26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 TTLL6Q8N841 843 aa26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 HSD17B14Q9BPX1 270 aa26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa26.16■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 GRIN2DO15399 1336 aa26.15■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 EYA4O95677 639 aa26.15■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 POLD1P28340 1107 aa26.15■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNH2Q12809 1159 aa26.15■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.15■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 PSMD1Q99460 953 aa26.15■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 GDF3Q9NR23 364 aa26.15■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 SKOR1P84550 965 aa26.15■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 NAB2Q15742 525 aa26.15■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 OGFOD1Q8N543 542 aa26.15■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.15■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 PSMD10O75832 226 aa26.14■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 POLR2MP0CAP2 368 aa26.14■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 PIGOQ8TEQ8 1089 aa26.14■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 MS4A14Q96JA4 679 aa26.14■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 VCPKMTQ9H867 229 aa26.14■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 GRID2IPA4D2P6 1211 aa26.14■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 GNGT1P63211 74 aa26.14■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 TTMPQ5BVD1 217 aa26.14■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.14■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 GANQ9H2C0 597 aa26.14■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD65E5RJM6 399 aa26.13■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 SLITRK3O94933 977 aa26.13■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 NOP2P46087 812 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 CCT5P48643 541 aa26.13■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 LRCH2Q5VUJ6 765 aa26.13■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 RINT1Q6NUQ1 792 aa26.13■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXO28Q9NVF7 368 aa26.13■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 EBAG9O00559 213 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 PDXKO00764 312 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 CHMP2AO43633 222 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 PALMO75781 387 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 CPP00450 1065 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNA1Q09470 495 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 TRAF1Q13077 416 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 PAK2Q13177 524 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC18A3Q16572 532 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 BMT2Q1RMZ1 405 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 BCAS4Q8TDM0 211 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 CHURC1Q8WUH1 139 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC5A5Q92911 643 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 ARL8AQ96BM9 186 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 DYDC2Q96IM9 177 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 ASTN1O14525 1302 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 SHTN1A0MZ66 631 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB39O15060 712 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 GLI1P08151 1106 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 FRMD5Q7Z6J6 570 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 PACS2Q86VP3 889 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 ZIM3Q96PE6 472 aa26.12■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 SFI1A8K8P3 1242 aa26.11■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP2R5CQ13362 524 aa26.11■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 TEX2Q8IWB9 1127 aa26.11■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 TPH2Q8IWU9 490 aa26.11■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 TBCAO75347 108 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 AKAP3O75969 853 aa26.11■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNA3P22001 575 aa26.11■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 SKIDA1Q1XH10 827 aa26.11■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.11■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 MEI1Q5TIA1 1274 aa26.11■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 MREGQ8N565 214 aa26.11■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 TUFT1Q9NNX1 390 aa26.11■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D12O60347 775 aa26.1■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 GCNT3O95395 438 aa26.1■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 CAP2P40123 477 aa26.1■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 EPS15P42566 896 aa26.1■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 RAPGEF1Q13905 1077 aa26.1■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 TADA2BQ86TJ2 420 aa26.1■■□□□ 1.77
AMIGO1-201ENST00000369862 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms