RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365039.1

RNU6-590P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 590, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-590P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-590P-201ENST00000365039 VASNQ6EMK4 673 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 SUSD1Q6UWL2 747 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 ADHFE1Q8IWW8 467 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 MB21D1Q8N884 522 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 ARMC5Q96C12 935 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 ZNF524Q96C55 264 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 MCMBPQ9BTE3 642 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 AOX1Q06278 1338 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 DDNO94850 711 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 THBDP07204 575 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 FAM90A13PP0C7W8 464 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 FAM90A24PP0C7X0 464 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 ADAM15Q13444 863 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 TP53BP2Q13625 1128 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 MCM6Q14566 821 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 ACAP1Q15027 740 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 RABEP1Q15276 862 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 LRRC41Q15345 812 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 MBLAC2Q68D91 279 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 PRR13Q9NZ81 148 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 PPM1HQ9ULR3 514 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 MAST3O60307 1309 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 SNED1Q8TER0 1413 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 A0A1W2PRX2 142 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 PMS2P1A4D2B8 440 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 NOP2P46087 812 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 AUHQ13825 339 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 LLGL1Q15334 1064 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 RHBDF2Q6PJF5 856 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 NEK8Q86SG6 692 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 NRIP3Q9NQ35 241 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 HSPBP1Q9NZL4 362 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 ZNF652Q9Y2D9 606 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 MUC5ACP98088 5654 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 FAM90A10PA6NDY2 464 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 C22orf46C9J442 243 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 NCR1O76036 304 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 FAM13AO94988 1023 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 NDUFA10O95299 355 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 TGFB3P10600 412 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 FPR2P25090 351 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 RGS3P49796 1198 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 ARSHQ5FYA8 562 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 RCSD1Q6JBY9 416 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 SLC2A7Q6PXP3 512 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 NRACQ8N912 160 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 BRF1Q92994 677 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 EGLN1Q9GZT9 426 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 VPS16Q9H269 839 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 NLRP2Q9NX02 1062 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 SLC17A6Q9P2U8 582 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 PRR36Q9H6K5 1346 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 ARID3CA6NKF2 412 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 HTR3BO95264 441 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 MRE11P49959 708 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 KCNQ1P51787 676 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 WWC1Q8IX03 1113 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 TMEM192Q8IY95 271 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 ANKRD24Q8TF21 1146 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 PDLIM2Q96JY6 352 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 ADAM2Q99965 735 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 HERPUD2Q9BSE4 406 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 SLC46A2Q9BY10 475 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 OR10A2Q9H208 303 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 BTG4Q9NY30 223 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 WDR81Q562E7 1941 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 TRIM24O15164 1050 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 GPR182O15218 404 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 NPHS1O60500 1241 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 CLEC3AO75596 197 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 HMGCRP04035 888 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 EPHB2P29323 1055 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 GSTT1P30711 240 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 ZNF445P59923 1031 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 IRF9Q00978 393 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 TFF2Q03403 129 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 MST1LQ2TV78 715 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 BEAN1Q3B7T3 259 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 AKNAD1Q5T1N1 836 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-590P-201ENST00000365039 ABHD17BQ5VST6 288 aa0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms