RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF76P36508 570 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 MMP14P50281 582 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 JAM2P57087 298 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 TRADDQ15628 312 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 EMC10Q5UCC4 262 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 SYCE1Q8N0S2 351 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.354e-9■□□□□ 11.1
PTDSS1-201ENST00000337004 SIX2Q9NPC8 291 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 OLFML3Q9NRN5 406 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 VAV3Q9UKW4 847 aa23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 CASP4P49662 377 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 CACNB3P54284 484 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 PEX26Q7Z412 305 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 GMCL1Q96IK5 515 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 CLIC2O15247 247 aa23.45■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 FERP16591 822 aa23.45■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 ATP1A2P50993 1020 aa23.45■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 PDCLQ13371 301 aa23.45■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.45■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.45■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.45■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.45■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 MRIQ9BWK5 157 aa23.45■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 NENFQ9UMX5 172 aa23.45■■□□□ 1.35
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC188H7C350 402 aa23.45■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 METTL13Q8N6R0 699 aa23.45■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa23.45■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 GOLPH3Q9H4A6 298 aa23.45■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 RABEP2Q9H5N1 569 aa23.45■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM169AQ9Y6X4 670 aa23.45■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 GOLGA6L10A6NI86 522 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 ALDH1B1P30837 517 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 STAT1P42224 750 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 NPEPPSP55786 919 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 ERVK-9P63128 1117 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 SLFN11Q7Z7L1 901 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRC45Q96CN5 670 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 IDI2Q9BXS1 227 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 NDUFAB1O14561 156 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 CYP3A4P08684 503 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 NPR1P16066 1061 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
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PTDSS1-201ENST00000337004 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 PODNQ7Z5L7 613 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 PLAAQ9Y263 795 aa23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 SART1O43290 800 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 GFPT2O94808 682 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 NDUFB10O96000 172 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 NR1D1P20393 614 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 LRIG3Q6UXM1 1119 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 TADA2BQ86TJ2 420 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 DNAAF5Q86Y56 855 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 AP1M1Q9BXS5 423 aa23.43■■□□□ 1.34
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PTDSS1-201ENST00000337004 KRIT1O00522 736 aa23.43■■□□□ 1.34
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PTDSS1-201ENST00000337004 FAM13AO94988 1023 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 KCNA1Q09470 495 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 CEP85LQ5SZL2 805 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 RGL1Q9NZL6 768 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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PTDSS1-201ENST00000337004 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
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PTDSS1-201ENST00000337004 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM186BQ8IYM0 893 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 RASGEF1CQ8N431 466 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 MYCT1Q8N699 235 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 BORCS6Q96GS4 357 aa23.42■■□□□ 1.34
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PTDSS1-201ENST00000337004 SFI1A8K8P3 1242 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 EML1O00423 815 aa23.42■■□□□ 1.34
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