RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 CYP3A4P08684 503 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 CRKP46108 304 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 ERVK-9P63128 1117 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 RASGEF1CQ8N431 466 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 MSH4O15457 936 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 GUCY2FP51841 1108 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 TADA2BQ86TJ2 420 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 FBXO11Q86XK2 927 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 SH2D3CQ8N5H7 860 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.538e-17■□□□□ 8.9
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HOXD1-201ENST00000331462 EFCC1Q9HA90 598 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 TBCAO75347 108 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 H2AFZP0C0S5 128 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 SLURP2P0DP57 97 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 FERP16591 822 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 H2AFVQ71UI9 128 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 SYCE1Q8N0S2 351 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 RUSC1Q9BVN2 902 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 GCNT4Q9P109 453 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 ICA1Q05084 483 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 PDCLQ13371 301 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 KLHL7Q8IXQ5 586 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 FAM169AQ9Y6X4 670 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 AFF2P51816 1311 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 NOP2P46087 812 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 METTL13Q8N6R0 699 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 OLIG1Q8TAK6 271 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 PIK3CDO00329 1044 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.534e-9■■■■■ 28.7
HOXD1-201ENST00000331462 CEP104O60308 925 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 RSPH10BP0C881 870 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 NR1D1P20393 614 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 CASP4P49662 377 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 TRADDQ15628 312 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 DOK7Q18PE1 504 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 MKNK1Q9BUB5 465 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 NCANO14594 1321 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 F5H6K3 240 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 TGFB1I1O43294 461 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 GCNT3O95395 438 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 KLRC3Q07444 240 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 KCTD16Q68DU8 428 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 PACS2Q86VP3 889 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC45Q96CN5 670 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 UBE4BO95155 1302 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 OPLAHO14841 1288 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 SLC30A5Q8TAD4 765 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 SEC14L1Q92503 715 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 TUFT1Q9NNX1 390 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 PLAAQ9Y263 795 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD65E5RJM6 399 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 SART1O43290 800 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 NDUFB10O96000 172 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 NPR1P16066 1061 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 LSP1P33241 339 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 STAT1P42224 750 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 TCERG1LQ5VWI1 586 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 RINT1Q6NUQ1 792 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 PEX26Q7Z412 305 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 NT5DC3Q86UY8 548 aa24.58■■□□□ 1.53
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