RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317620.13

PROM2-201, Transcript of prominin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PROM2, Length 4,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2-201ENST00000317620 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 TTC26A0AVF1 554 aa14.62□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 INHBAP08476 426 aa14.62□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 FCER1AP12319 257 aa14.62□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.62□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 OATP04181 439 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 RASSF2P50749 326 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 MAPK6Q16659 721 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 RHOT2Q8IXI1 618 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 SENP2Q9HC62 589 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 A0A0G2JLW4 131 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 ADCY1Q08828 1119 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 NAA25Q14CX7 972 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 LDHDQ86WU2 507 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 CDKL2Q92772 493 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 DENND3A2RUS2 1198 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 MCF2LO15068 1137 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 PDE1BQ01064 536 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 ZNF543Q08ER8 600 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 NEK9Q8TD19 979 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 LXNQ9BS40 222 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.61□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 FGGP02679 453 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 BASP1P80723 227 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 ERICH1Q86X53 443 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 TCP11Q8WWU5 503 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 PALMO75781 387 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 ARL4AP40617 200 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 CEP55Q53EZ4 464 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 METTL23Q86XA0 190 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 FAM167AQ96KS9 214 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 SRGAP2O75044 1071 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 SLCO1A2P46721 670 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 CCT5P48643 541 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 RWDD2BP57060 319 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 LRRC8CQ8TDW0 803 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 TRIM9Q9C026 710 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 ABCB6Q9NP58 842 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 ADAM22Q9P0K1 906 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.6□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 NDUFB10O96000 172 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 ACTN1P12814 892 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 SFNP31947 248 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 USP49Q70CQ1 688 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 KCTD6Q8NC69 237 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 PRPSAP2O60256 369 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 CASP8Q14790 479 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 RPS6KA2Q15349 733 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 KAZALD1Q96I82 304 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 SCYL1Q96KG9 808 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 RGL1Q9NZL6 768 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 DR1Q01658 176 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 FMO2Q99518 471 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.59□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 PSMC5P62195 406 aa14.58□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 PDIA5Q14554 519 aa14.58□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.58□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 HPS3Q969F9 1004 aa14.58□□□□□ -0.07
PROM2-201ENST00000317620 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms