RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 USP11P51784 963 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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HPS6-201ENST00000299238 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 EPN3Q9H201 632 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 NCK2O43639 380 aa22.02■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 NDUFB10O96000 172 aa22.02■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 AP3B2Q13367 1082 aa22.02■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.02■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.02■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.02■■□□□ 1.12
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HPS6-201ENST00000299238 CREG2Q8IUH2 290 aa22.02■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 CNKSR1Q969H4 720 aa22.02■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 GMCL1Q96IK5 515 aa22.02■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 MBOAT7Q96N66 472 aa22.02■■□□□ 1.12
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HPS6-201ENST00000299238 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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HPS6-201ENST00000299238 POTECB2RU33 542 aa22.01■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 TRAF5O00463 557 aa22.01■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 TACC1O75410 805 aa22.01■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 CYP3A7P24462 503 aa22.01■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 JAG1P78504 1218 aa22.01■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 POTEBQ6S5H4 581 aa22.01■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.01■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 AMNQ9BXJ7 453 aa22.01■■□□□ 1.11
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HPS6-201ENST00000299238 NOL4O94818 638 aa22.01■■□□□ 1.11
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HPS6-201ENST00000299238 PLCB4Q15147 1175 aa22.01■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.01■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 PSME4Q14997 1843 aa22.01■■□□□ 1.11
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HPS6-201ENST00000299238 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22■■□□□ 1.11
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HPS6-201ENST00000299238 GH2P01242 217 aa22■■□□□ 1.11
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HPS6-201ENST00000299238 DNA2P51530 1060 aa22■■□□□ 1.11
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HPS6-201ENST00000299238 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22■■□□□ 1.11
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HPS6-201ENST00000299238 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22■■□□□ 1.11
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HPS6-201ENST00000299238 NLRP14Q86W24 1093 aa21.99■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 FBXO11Q86XK2 927 aa21.99■■□□□ 1.11
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HPS6-201ENST00000299238 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.99■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa21.99■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 OPA1O60313 960 aa21.99■■□□□ 1.11
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HPS6-201ENST00000299238 TRIM59Q8IWR1 403 aa21.99■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 CCDC65Q8IXS2 484 aa21.99■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.99■■□□□ 1.11
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HPS6-201ENST00000299238 YDJCA8MPS7 323 aa21.98■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 SLC26A4O43511 780 aa21.98■■□□□ 1.11
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HPS6-201ENST00000299238 MED24O75448 989 aa21.98■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 ARID5AQ03989 594 aa21.98■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 PTGISQ16647 500 aa21.98■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 C6orf89Q6UWU4 347 aa21.98■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 CSRNP1Q96S65 589 aa21.98■■□□□ 1.11
HPS6-201ENST00000299238 ATAD5Q96QE3 1844 aa21.98■■□□□ 1.11
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