RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.08■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 LCTP09848 1927 aa25.08■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 SORBS3O60504 671 aa25.08■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 MOGSQ13724 837 aa25.08■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 WDR59Q6PJI9 974 aa25.08■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 KIF18AQ8NI77 898 aa25.08■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.08■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.08■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.08■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 BACH1O14867 736 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 CLIC2O15247 247 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 CNMDO75829 334 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 STAM2O75886 525 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 POTEJP0CG39 1038 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 ZBED6P86452 979 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 DNERQ8NFT8 737 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 IWS1Q96ST2 819 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO40Q9UH90 709 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0U1RQJ8 604 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 NR3C1P04150 777 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 ETF1P62495 437 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 SP4Q02446 784 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 PLA2G4FQ68DD2 849 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 ATRIPQ8WXE1 791 aa25.07■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 PFASO15067 1338 aa25.06■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PQJ5 194 aa25.06■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 KCNMA1Q12791 1236 aa25.06■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 GNPTABQ3T906 1256 aa25.06■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 ACRBPQ8NEB7 543 aa25.06■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 RDM1Q8NG50 284 aa25.06■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 CDHR1Q96JP9 859 aa25.06■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 AKAP3O75969 853 aa25.05■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 NPEPPSP55786 919 aa25.05■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 STXBP2Q15833 593 aa25.05■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.05■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 GABBR1Q9UBS5 961 aa25.05■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.05■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.05■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa25.05■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 GJA5P36382 358 aa25.05■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 SP2Q02086 613 aa25.05■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 DNAI1Q9UI46 699 aa25.05■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 NFASCO94856 1347 aa25.05■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 CASP4P49662 377 aa25.04■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 MEA1Q16626 185 aa25.04■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 XKR9Q5GH70 373 aa25.04■■□□□ 1.6
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VSTM4-201ENST00000298454 ANO5Q75V66 913 aa25.04■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
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VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25.04■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 FANCGO15287 622 aa25.04■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
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VSTM4-201ENST00000298454 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.04■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.04■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 SCN4AP35499 1836 aa25.03■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 SOWAHBA6NEL2 793 aa25.03■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 POTEB2H3BUK9 544 aa25.03■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF862O60290 1169 aa25.03■■□□□ 1.6
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VSTM4-201ENST00000298454 SWSAP1Q6NVH7 229 aa25.03■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.03■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 STRA6Q9BX79 667 aa25.03■■□□□ 1.6
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VSTM4-201ENST00000298454 GPRC5CQ9NQ84 441 aa25.03■■□□□ 1.6
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VSTM4-201ENST00000298454 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 FAM184BQ9ULE4 1060 aa25.03■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa25.03■■□□□ 1.6
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VSTM4-201ENST00000298454 GRIN3BO60391 1043 aa25.03■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R37O75864 691 aa25.03■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 ACTR2P61160 394 aa25.03■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 KCNH2Q12809 1159 aa25.03■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 IQCDQ96DY2 449 aa25.03■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 K7ENM7 598 aa25.02■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.02■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 CRACR2AQ9BSW2 395 aa25.02■■□□□ 1.6
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