RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 MMP1P03956 469 aa22.26■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 ATP4AP20648 1035 aa22.26■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 RPS6KB1P23443 525 aa22.26■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 GNA11P29992 359 aa22.26■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.26■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 P2RX5Q93086 422 aa22.26■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.26■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.26■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.26■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 PPFIA3O75145 1194 aa22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 RPS6KA5O75582 802 aa22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 LTBRP36941 435 aa22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 HYAL1Q12794 435 aa22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 PRR16Q569H4 304 aa22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 FBXL16Q8N461 479 aa22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 FAM50BQ9Y247 325 aa22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 GATMP50440 423 aa22.24■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 CAMK1Q14012 370 aa22.24■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 NTRK3Q16288 839 aa22.24■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.24■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.24■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.24■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.24■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.24■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 MGEA5O60502 916 aa22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 GPR37L1O60883 481 aa22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 C22orf31O95567 290 aa22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 ITGB1P05556 798 aa22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 PSAPP07602 524 aa22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 PSMA5P28066 241 aa22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 CIITAP33076 1130 aa22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 BICD2Q8TD16 824 aa22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 IGFLR1Q9H665 355 aa22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 EVPLQ92817 2033 aa22.23■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 MYO7AQ13402 2215 aa22.22■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 DENND3A2RUS2 1198 aa22.22■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 KIZQ2M2Z5 673 aa22.22■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 ODR4Q5SWX8 454 aa22.22■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 METTL13Q8N6R0 699 aa22.22■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.22■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.22■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 ADAM2Q99965 735 aa22.22■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.22■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.22■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.22■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 SAMM50Q9Y512 469 aa22.22■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 GPR182O15218 404 aa22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 REC8O95072 547 aa22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 VTNP04004 478 aa22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 IFNAR1P17181 557 aa22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 DNAJB1P25685 340 aa22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 CLUL1Q15846 466 aa22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 LENG9Q96B70 501 aa22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 OSMRQ99650 979 aa22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 RGS18Q9NS28 235 aa22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.21■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 LINC01565O15544 149 aa22.2■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 PLA2G5P39877 138 aa22.2■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 EVCP57679 992 aa22.2■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 ZP2Q05996 745 aa22.2■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.2■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 WDR64B1ANS9 1081 aa22.19■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 C9IYK1 514 aa22.19■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 TBX10O75333 385 aa22.19■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 GPR32O75388 356 aa22.19■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 IRS1P35568 1242 aa22.19■■□□□ 1.14
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