RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 MBOAT7Q96N66 472 aa25.27■■□□□ 1.64
SYT6-210ENST00000641643 GABBR1Q9UBS5 961 aa25.27■■□□□ 1.64
SYT6-210ENST00000641643 EFCAB14O75071 495 aa25.26■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 KRT40Q6A162 431 aa25.26■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.26■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 RPAINQ86UA6 219 aa25.26■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa25.26■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 DNAJB3Q8WWF6 145 aa25.26■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa25.25■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 MARCH6O60337 910 aa25.25■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.25■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa25.25■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.25■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.25■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 KIF28PB7ZC32 967 aa25.24■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 SLC37A4O43826 429 aa25.24■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 PSMD10O75832 226 aa25.24■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 ZNF484Q5JVG2 852 aa25.24■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 MIER3Q7Z3K6 550 aa25.24■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 DBF4BQ8NFT6 615 aa25.24■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 ETNPPLQ8TBG4 499 aa25.24■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 C8orf76Q96K31 380 aa25.24■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa25.24■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 CDH23Q9H251 3354 aa25.23■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 BTBD18B2RXH4 712 aa25.23■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 RABGGTBP53611 331 aa25.23■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 FAM26DQ5JW98 314 aa25.23■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 RDM1Q8NG50 284 aa25.23■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 FAM167AQ96KS9 214 aa25.23■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 ZNF576Q9H609 170 aa25.23■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 CEP131Q9UPN4 1083 aa25.23■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 COL1A2P08123 1366 aa25.23■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 M0QZ92 97 aa25.22■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 ATP4AP20648 1035 aa25.22■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 WDR5P61964 334 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 IER5Q5VY09 327 aa25.22■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 MTHFD1LQ6UB35 978 aa25.22■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 SEPT8Q92599 483 aa25.22■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.22■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 CHRNA1P02708 482 aa25.22■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 KLRC1P26715 233 aa25.22■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 GUCY1B3Q02153 619 aa25.22■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa25.22■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 FAM20AQ96MK3 541 aa25.22■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 GUCD1Q96NT3 240 aa25.22■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 SLC28A3Q9HAS3 691 aa25.22■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa25.22■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa25.21■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 HERC6Q8IVU3 1022 aa25.21■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 TNFRSF25Q93038 417 aa25.21■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa25.21■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 KCNMB3Q9NPA1 279 aa25.21■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 NRBP2Q9NSY0 501 aa25.21■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa25.21■■□□□ 1.63
SYT6-210ENST00000641643 FAM205CA6NFA0 338 aa25.2■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 TBX3O15119 743 aa25.2■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 NME8Q8N427 588 aa25.2■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 APBB2Q92870 758 aa25.2■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 ZBED2Q9BTP6 218 aa25.2■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa25.2■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 CDY2AQ9Y6F7 541 aa25.2■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 MYO9BQ13459 2157 aa25.2■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 MCM2P49736 904 aa25.19■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 POTEDQ86YR6 584 aa25.19■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 OATP04181 439 aa25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 GHRP10912 638 aa25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 PRKCEQ02156 737 aa25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 MGAT3Q09327 533 aa25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 TMEM62Q0P6H9 643 aa25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 TCTN1Q2MV58 587 aa25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 PPP2R2DQ66LE6 453 aa25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 SLFN12Q8IYM2 578 aa25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 TLL1O43897 1013 aa25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 AMHP03971 560 aa25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 MYOGP15173 224 aa25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 DEFB103AP81534 67 aa25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 METTL13Q8N6R0 699 aa25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 KIF3AQ9Y496 699 aa25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 TRPV2Q9Y5S1 764 aa25.18■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 ZBTB42B2RXF5 422 aa25.17■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 MAGEB2O15479 319 aa25.17■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 ZNF862O60290 1169 aa25.17■■□□□ 1.62
SYT6-210ENST00000641643 PPP2R5CQ13362 524 aa25.17■■□□□ 1.62
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