RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		18.72	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	IER5	Q5VY09	327 aa		18.72	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		18.72	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		18.72	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	IL27	Q8NEV9	243 aa		18.72	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		18.72	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	OXER1	Q8TDS5	423 aa		18.72	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIF2C	Q99661	725 aa		18.72	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		18.72	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		18.72	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		18.72	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		18.72	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	MBTPS1	Q14703	1052 aa		18.71	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM26D	Q5JW98	314 aa		18.71	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		18.71	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPAIN	Q86UA6	219 aa		18.71	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		18.71	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM167A	Q96KS9	214 aa		18.71	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		18.71	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		18.71	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	MMP1	P03956	469 aa		18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	KLRC1	P26715	233 aa		18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	NR5A1	Q13285	461 aa		18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRT40	Q6A162	431 aa		18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	NME8	Q8N427	588 aa		18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	RDM1	Q8NG50	284 aa		18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	C8orf76	Q96K31	380 aa		18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM20A	Q96MK3	541 aa		18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	MBOAT7	Q96N66	472 aa		18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	GUCD1	Q96NT3	240 aa		18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		18.7	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	COL1A2	P08123	1366 aa		18.69	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	BTBD18	B2RXH4	712 aa		18.69	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	TLL1	O43897	1013 aa		18.69	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSMD10	O75832	226 aa		18.69	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHRNA1	P02708	482 aa		18.69	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	AMH	P03971	560 aa		18.69	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		18.69	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	APBB2	Q92870	758 aa		18.69	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	GJA10	Q969M2	543 aa		18.69	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		18.69	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		18.68	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYOG	P15173	224 aa		18.68	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	ST3GAL1	Q11201	340 aa		18.68	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	GRIN2C	Q14957	1233 aa		18.68	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		18.68	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		18.68	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	TBX3	O15119	743 aa		18.67	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC37A4	O43826	429 aa		18.67	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	OAT	P04181	439 aa		18.67	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	GHR	P10912	638 aa		18.67	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	FOSL2	P15408	326 aa		18.67	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP4A	P20648	1035 aa		18.67	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	GUCY1B3	Q02153	619 aa		18.67	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		18.67	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		18.67	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	METTL13	Q8N6R0	699 aa		18.67	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYLIP	Q8WY64	445 aa		18.67	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		18.67	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAGEB2	O15479	319 aa		18.66	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	CA3	P07451	260 aa		18.66	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMOD1	P28289	359 aa		18.66	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	DEFB103A	P81534	67 aa		18.66	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRKCE	Q02156	737 aa		18.66	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		18.66	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		18.66	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP38	Q8NB14	1042 aa		18.66	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	GINS2	Q9Y248	185 aa		18.66	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIF3A	Q9Y496	699 aa		18.66	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	TET1	Q8NFU7	2136 aa		18.65	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	18.65	■□□□□ 0.58	2e-6	■■■■■ 29.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	MCM2	P49736	904 aa		18.65	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	MGAT3	Q09327	533 aa		18.65	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCTN1	Q2MV58	587 aa		18.65	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		18.65	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	18.65	■□□□□ 0.58	3e-6	■■□□□ 11.4
JMJD1C-211	ENST00000633035	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		18.65	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNFRSF25	Q93038	417 aa		18.65	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		18.65	■□□□□ 0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		18.65	■□□□□ 0.58

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