RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 NLRX1Q86UT6 975 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 IQUBQ8NA54 791 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC150Q8NCX0 1101 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 TOX2Q96NM4 488 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 GSDMAQ96QA5 445 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 CLTBP09497 229 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 GNA11P29992 359 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 MCM7P33993 719 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 CHMP4BP1P59074 171 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 PSMC6P62333 389 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM39AQ9NV64 488 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 ESYT2A0FGR8 921 aa24.04■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 GGPS1O95749 300 aa24.04■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 CDK7P50613 346 aa24.04■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 DPYDQ12882 1025 aa24.04■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 IL17AQ16552 155 aa24.04■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa24.04■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 TLR3O15455 904 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 CCZ1BP86790 482 aa24.03■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 SP2Q02086 613 aa24.03■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 DGKDQ16760 1214 aa24.03■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.03■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 SPATA33Q96N06 139 aa24.03■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 MMP3P08254 477 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 ATP1A3P13637 1013 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF18P17022 549 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 PRPHP41219 470 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 PRO3102Q9H379 93 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 PDLIM7Q9NR12 457 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 FANCLQ9NW38 375 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM260Q9NX78 707 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 LAMA3Q16787 3333 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 ICAM3P32942 547 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 UBASH3AP57075 661 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 FAAP100Q0VG06 881 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 AP3B2Q13367 1082 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 NEDD9Q14511 834 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 CDHR1Q96JP9 859 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.01■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 SKILP12757 684 aa24.01■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 KCNJ6P48051 423 aa24.01■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.01■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 MCTP2Q6DN12 878 aa24.01■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 PDXDC2PQ6P474 469 aa24.01■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 PPTC7Q8NI37 304 aa24.01■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 ANO3Q9BYT9 981 aa24.01■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 GRIN2DO15399 1336 aa24■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 SZT2Q5T011 3432 aa24■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM43BA6NCK2 446 aa24■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 SERPINC1P01008 464 aa24■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 RAG1P15918 1043 aa24■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF76P36508 570 aa24■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 TXLNAP40222 546 aa24■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 ARID5BQ14865 1188 aa24■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 CYFIP1Q7L576 1253 aa24■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 TMC6Q7Z403 805 aa24■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 MYRIPQ8NFW9 859 aa24■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 GDF15Q99988 308 aa24■■□□□ 1.43
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SGMS1-210ENST00000619438 PPFIA4O75335 1185 aa23.99■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 MTMR1Q13613 665 aa23.99■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 NBPF20Q3BBV1 942 aa23.99■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.99■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.99■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.99■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 GPRASP2Q96D09 838 aa23.99■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 ITGB5P18084 799 aa23.99■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 SEMA3FQ13275 785 aa23.99■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 FAM126BQ8IXS8 530 aa23.99■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa23.99■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.99■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 LTBP2Q14767 1821 aa23.98■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 UQCRHLA0A096LP55 91 aa23.98■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 MAFGO15525 162 aa23.98■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 UQCRHP07919 91 aa23.98■■□□□ 1.43
SGMS1-210ENST00000619438 AFMP43652 599 aa23.98■■□□□ 1.43
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