RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 PACSIN1Q9BY11 444 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 AZI2Q9H6S1 392 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CFAP73A6NFT4 308 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 KRT2P35908 639 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PTGDRQ13258 359 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TMTC2Q8N394 836 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 NOX5Q96PH1 765 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM237Q96Q45 408 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM51Q9BSJ1 452 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TTYH3Q9C0H2 523 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC53A6NM62 1247 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SRGNP10124 158 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ABCD1P33897 745 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MCM7P33993 719 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 DNM2P50570 870 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ITIH3Q06033 890 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CHRNDQ07001 517 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 BIRC3Q13489 604 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 NFIXQ14938 502 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 VGLL2Q8N8G2 317 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TTC8Q8TAM2 541 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 DYDC1Q8WWB3 177 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MAIP1Q8WWC4 291 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 FGD4Q96M96 766 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 AFF2P51816 1311 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 STK36Q9NRP7 1315 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TOM1O60784 492 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ALADP13716 330 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SERPINB4P48594 390 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 GNAQP50148 359 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SLMAPQ14BN4 828 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 KIFAP3Q92845 792 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SWAP70Q9UH65 585 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MROH5Q6ZUA9 1318 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ABCC12Q96J65 1359 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 H7C1D1 291 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TTI1O43156 1089 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 OATP04181 439 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 FUT4P22083 530 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 KLRC1P26715 233 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 NLRP5P59047 1200 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 COPS2P61201 443 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MYBPC3Q14896 1274 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ALX1Q15699 326 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 GALNT17Q6IS24 598 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD42Q8N9B4 389 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 GDAP1Q8TB36 358 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 FBF1Q8TES7 1133 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 P3H4Q92791 437 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC45Q96CN5 670 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 GALNT8Q9NY28 637 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MYH7BA7E2Y1 1941 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MYH7P12883 1935 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MYH6P13533 1939 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 GSTA1P08263 222 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA31D3P0C874 917 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 GM2AP17900 193 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 GNAT2P19087 354 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TNNC1P63316 161 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 LRIG3Q6UXM1 1119 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 FITM2Q8N6M3 262 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RMDN2Q96LZ7 410 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ISCUQ9H1K1 167 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RMI1Q9H9A7 625 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa8.9□□□□□ -0.99
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PQC6 194 aa8.9□□□□□ -0.99
PTPRT-211ENST00000618610 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
PTPRT-211ENST00000618610 TCP11X1B4DZS4 312 aa8.9□□□□□ -0.99
PTPRT-211ENST00000618610 F8VZ95 297 aa8.9□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms